专利名称:基于多标记学习的抗菌肽活性预测方法专利类型:发明专利
发明人:周丰丰,王普,肖绚,葛瑞泉,刘记奎申请号:CN201410712399.6申请日:20141128公开号:CN104484580A公开日:20150401
摘要:基于多标记学习的抗菌肽活性预测方法通过提取肽序列对应的氨基酸成分,然后根据物理化学属性编码获取对应的矩特征,共同构成肽序列的特征向量。每条肽序列的特征向量是由两部分构成,一是氨基酸成分,二是基于物理化学属性编码提取的矩特征。采用最小二乘的多标记学习算法计算最小化变换矩阵W,则能够通过变换矩阵W得出待测样本的各标记输出,根据各标记输出获取预测类标签向量集合。根据类标签向量集合快速准确预测抗菌肽序列的活性。因此,能够获取肽序列各个角度的形状特定,从而能够快速、准确、自动标注抗菌肽活性。
申请人:深圳先进技术研究院
地址:518055 广东省深圳市南山区西丽大学城学苑大道1068号
国籍:CN
代理机构:广州华进联合专利商标代理有限公司
代理人:吴平
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