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布鲁克核磁共振仪初学者入门手册

来源:尚车旅游网


AVANCE SGU Based Frequency Generation

初学者入门手册 中文版 003

版本号 003

本手册所包含信息的更新、变更不再进行通知

BRUKER 不承担依照本手册进行操作所造成的一切后果。

BRUKER 不负责在安装或实验操作中由于本手册所包含的错误而导致的偶然损害。 严禁在未取得出版者书面许可的情况下,对手册全部或部分内容进行引用或者翻译。

作者:Eamonn Butler 出版:Stanley J.Niles 2003年12月12日

翻译:高玉波 Yubo.Gao 校对:

2006年5月21日

目 录

目 录.................................................................................................................................................3 1 简介.............................................................................................................................................7

1.1可能的损害.......................................................................................................................7

1.1.1软件版本及命令语法...........................................................................................8

2 安全注意事项...............................................................................................................................9

2.1简述.....................................................................................................................................9 2.2 关于磁性的安全注意事项................................................................................................9 2.2.1 内部区域安全注意事项...............................................................................................10 2.2.2 外部区域安全注意事项...............................................................................................11 2.3 关于深冷液体的安全注意事项......................................................................................11 2.4 关于电气的安全注意事项..............................................................................................11 2.5 关于化学的安全注意事项..............................................................................................11 2.6 关于CE认证.....................................................................................................................11 3 理论及术语说明.........................................................................................................................13

3.1 简介..................................................................................................................................13 3.2 氯仿的NMR分析.............................................................................................................15 3.3 标样,赫兹,ppm...........................................................................................................17 3.4 质子NMR——化学位移.................................................................................................18 3.5苯的质子频谱...................................................................................................................19 3.6 乙酸苄酯(Benzylacetate)的质子频谱........................................................................20 3.7 带自旋/自旋耦合的乙基苯质子频谱.............................................................................21 3.8 去耦..................................................................................................................................23 3.9 FID和频谱........................................................................................................................24 4 系统介绍.....................................................................................................................................27

4.1 简介..................................................................................................................................27 4.2 操作控制台及其连接......................................................................................................27 4.3 机柜..................................................................................................................................28 4.4 主机与AQS间的连接......................................................................................................29 4.5 磁体、匀场系统、HPPR和探头....................................................................................29 4.6 磁体和磁体杜瓦..............................................................................................................31

4.6.1 室温腔管..............................................................................................................32 4.6.2 液氦腔..................................................................................................................32 4.6.3 液氮腔..................................................................................................................33 4.7 锁场系统简介..................................................................................................................33 4.8 探头..................................................................................................................................34

4.8.1 双模13C/1H探头...............................................................................................36 4.8.2 更换探头..............................................................................................................38

5 NMR样品....................................................................................................................................39

5.1 简介..................................................................................................................................39 5.2 溶剂选择..........................................................................................................................39 5.3 样品管..............................................................................................................................40

目 录

5.4 样品处理..........................................................................................................................41 6 实验基本步骤.............................................................................................................................43

6.1 简介..................................................................................................................................43 6.2 BSMS键盘........................................................................................................................43

6.2.1保存一组匀场值(wsh命令)............................................................................44 6.2.2 读取一组匀场值(rsh命令)............................................................................44 6.2.3 BSMS功能...........................................................................................................45 6.2.4 样品控制功能......................................................................................................45 6.2.5 手动锁场功能......................................................................................................45 6.2.6 手动匀场功能......................................................................................................46 6.2.7 液氦高度功能......................................................................................................46 6.3 将样品管插入转子..........................................................................................................47 6.4 将带样品管的转子放入磁体..........................................................................................47 6.5 旋转样品..........................................................................................................................48 6.6 调谐和匹配探头..............................................................................................................49

6.6.1 使用wobble曲线进行调谐和匹配.....................................................................49 6.6.2 使用HPPR LED进行调谐和匹配......................................................................51 6.6.3 对多个核进行调谐和匹配..................................................................................52 6.7 锁定样品..........................................................................................................................53

6.7.1 锁场步骤.............................................................................................................. 6.8 匀场..................................................................................................................................55

6.8.1 初始匀场..............................................................................................................56 6.8.2 常规匀场..............................................................................................................56

7准备采样——数据集, edasp、eda命令.................................................................................59

7.1 简介..................................................................................................................................59 7.2 数据集..............................................................................................................................59 7.3 创建数据集......................................................................................................................61 7.4 谱仪参数edasp.................................................................................................................62

7.4.1 edasp窗口布局....................................................................................................63 7.4.2 edasp窗口的一些特性........................................................................................65 7.5 基本采样参数:“eda”表..............................................................................................65

7.5.1 发射、基础和偏移频率的数学解释..................................................................72

8 脉冲程序 / ased命令.................................................................................................................75

8.1 脉冲程序“zg”和“zg30”............................................................................................75 8.2 “zg30”程序详解.............................................................................................................75 8.3 命令“ased”.....................................................................................................................77 9 氢谱.............................................................................................................................................79

9.1 前言..................................................................................................................................79 9.2 创建新数据集..................................................................................................................79 9.3 读取标准参数集..............................................................................................................80

9.3.1 “getprosol”表.....................................................................................................80 9.4 设置接收机增益..............................................................................................................80 9.5 进行采样..........................................................................................................................81 9.6 傅立叶变换和谱图相位校正..........................................................................................83

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目 录

9.7 基本处理:傅立叶变换..................................................................................................85 9.8 相位校正..........................................................................................................................85 9.9 谱图的校准......................................................................................................................87

9.9.1 水平放大图谱......................................................................................................88 9.9.2 图谱校准..............................................................................................................88 9.10 使用SW-SFO1功能调整谱宽......................................................................................

9.10.1 调整cholesterylacetate谱图的SW................................................................. 9.11 增加扫描次数................................................................................................................90 10 不去耦的13C谱.......................................................................................................................93

10.1 简介................................................................................................................................93 10.2 步骤................................................................................................................................93 11 去耦氢的13C谱.......................................................................................................................97

11.1 简介................................................................................................................................97 11.2 详细步骤........................................................................................................................97 11.3 确定去耦频率................................................................................................................98 11.4 调整去耦参数................................................................................................................99 11.5 脉冲程序zgpg30............................................................................................................99 12 基本故障排除.........................................................................................................................103

12.1 简介..............................................................................................................................103 12.2 打开和关闭谱仪..........................................................................................................103 12.3 谱仪开机......................................................................................................................103 12.4 谱仪关机......................................................................................................................104

12.4.1 在Windows系统运行Topspin........................................................................104

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正文开始

1 简介

这本手册的目的是帮助一个几乎没有经验的用户学习进行一系列基础的一维高分辨率NMR实验。我们采用Cholesterylacetate作为实验样品,描述怎样观察质子和碳核(去耦或者不去耦)。为了帮助用户学习,我们使用的是所有Topspin软件都包含的标准参数,当然,为了帮助用户理解不同参数的内在关系,我们付出了真正的努力,而不是仅仅把标准参数集读出来。事实上,这本手册将专注于对采集过程的描述,另外,还会提及对采集到的数据进行处理是多么花费时间。我们需要尽可能减少在谱仪上处理数据的时间,在训练一大批未毕业的学生时,这点非常重要。这种情况下,学生应该在谱仪教程文档的指导下,在另外一个工作站上方便地进行数据处理。

为了理解这本手册中指令的用途,用户应该拥有: 关于Topspin 软件包的基础知识;

一个或多个可以观察质子、观察碳核、去耦氢观察碳核的探头; BSMS键盘或控制面板的基础操作知识。

虽然我们努力提供了按步骤的详细描述,但新用户总会有一些问题,需要得到有经验的用户的支持。这本手册的目标是,实际也只能是,使用户对系统的操作有个基本的理解,能够开始工作。希望使用这本手册可以显著缩短新用户的培训时间。

1.1可能的损害 以后的章节将会详细地讨论安全注意事项,但现在必须明确指出在操作NMR谱仪时可能造成的损害。如此复杂的一套系统,偶然会出现无经验用户损坏仪器的情况,极少但最重要的一些值得列出来。正常操作中最可能导致伤害的情况有:

在盖着防尘盖时,从磁体中弹出样品管; 在没有压缩气体支持下往磁体内放入样品管; 发射的RF脉冲太长、太强或者又长又强;

往未连接的导线或者调谐不好的探头中传输RF能量。

建议新用户在开始操作前确认自己已经了解这些可能发生的损害。建议系统管理员确保任何新用户理解以上提到的情况。

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1 简介 1.1.1软件版本及命令语法

这本手册针对Topspin 1.1 版本编写。整本手册需要输入的命令的过程将被标出。需要输入的命令将在单引号内用粉红色标出。例如

输入‘eda’

意思是用键盘在命令行输入‘eda’然后按“Return”或者“Enter”或者“回车”键。

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2 安全注意事项

2.1简述

安全方面,NMR谱仪不同于绝大多数实验设备的地方在于其使用的强磁体。在布置实验室,训练在实验室内或者周围工作的人员时,这是最重要、首先要考虑的一点。如果遵守正确的操作规则,在强磁体附近工作是完全安全的,现在还没有发现其在医疗方面存在有害影响。粗心的话,无论如何都会造成严重的事故,所以让在磁体附近工作的人员完全理解可能出现的伤害情况是非常重要的。最重要的一点是,绝对不要允许使用心脏起搏器或者金属关节的人员接近磁体。

以下情况决定了磁体可能造成损坏: 1. 与磁性物体之间巨大的吸引力; 2. 内部包含的大量液氦和液氮。

2.2 关于磁性的安全注意事项

磁体周围存在一个磁场,这个场是不可见的,因此需要在周围区域设置警告标示。铁磁材料制作的物体(例如钢铁)会被吸引到磁体上。如果一个铁磁性物体离磁体太近,它会突然被惊人的力量吸进磁体,这可能伤害磁体,并伤害它们之间的人员!由于磁场的强度随着远离磁体的距离显著减弱,有必要讨论在两个广义区域的安全事项:内部区域和外部区域。在组织实验练习时,内部区域和外部区域的划分是很有帮助的。

两个区域的物理范围取决于磁体的大小,磁体越大,磁场会越强,两个区域的范围也会越大。图2.1展示了两个区域的范围(不符合比例)。关于不同磁体磁场的详细资料可以参考BASH光盘的Site Planning Guides。

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2 安全注意事项 图2.1 磁体内部及外部区域的安全注意事项

2.2.1 内部区域安全注意事项

内部区域是指从磁体中心到1mT(10高斯)线之间的区域。在这个区域内,物体可能突然被吸到磁体中心,磁体的吸引力会在很短的距离内由很难觉察增大到无法控制的程度。绝对不允许在这一区域内放置或者移动铁磁性重物。

在磁体上工作使用的任何梯子都应该是非铁磁性材料的,例如铝合金。补充液氦、液氮的杜瓦也必须是使用非磁性材料制成的。不要把小的金属件(例如改锥、螺栓)放在磁体附近的地面上,如果它们被吸进磁体的腔管内会导致严重的伤害,特别是当磁体没有安装探头时。

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U2.2.2 外部区域安全注意事项 佩戴机械手表进入内部区域可能损坏,数码手表可以安全佩戴。当然,下面即将讨论的外部区域安全措施同样适用于内部区域。

2.2.2 外部区域安全注意事项

外部区域是指从1mT线到0.3mT线之间的区域。磁场不会被墙壁、地板或者天花板阻挡,可能会延伸到相邻的房间。磁场可以消除存储在磁带或者磁盘上的信息。银行卡、安全通行证或者任何包含有磁条的设备都会被损害。光盘不受影响,但是光盘驱动器中可能有部件会受到影响。

当使用钢铁做成的压力气罐时,他们应该被放在外部区域以外(最好是在磁体室外面)并且必须被固定在墙壁上。如果太靠近磁场,计算机的彩色显示器的颜色显示会发生变形,但是好像不会造成永久伤害。一旦离开外部区域,所有针对磁体磁场的安全措施都将不再需要了。

2.3 关于深冷液体的安全注意事项

磁体内包含着大量的液氦和液氮,这些液体,被称为深冷液体,被用来把磁场线圈保存在极低的温度下。

由于其极低的温度,在处理深冷液体时,必须穿戴手套、长袖衬衫或者实验室工作服和防护眼镜。直接接触这些液体会导致冻伤。系统管理员必须定时检查并确认蒸发的气体可以顺利流出磁体,例如单向阀门没有被阻塞。不要尝试去给磁体补加液氦或者液氮,除非你接受过训练,理解正确的流程。

氦气和氮气是无毒气体。但是由于磁体存在失超的可能性,会导致房间可能会突然充满蒸发的气体,所以必须保证良好的通风。

2.4 关于电气的安全注意事项

谱仪的硬件与所有典型的电子或者气动硬件一样,具有同等的危害,应该认真对待。不要取下任何单元的任何保护面板。它们保证你不受到伤害,只有经过认证的专业人员才能打开它们。机柜后面的主面板可以通过两个快速螺钉取下,但是再次强调,这只能由经过训练的人员执行。请注意,除非拔掉电源,否则取下尾面板后,上面的的冷却风扇还将继续旋转。

2.5 关于化学的安全注意事项

用户应该完全理解自己所操作的化学样品的危险性。有机物可能是高度可燃的、具有强烈腐蚀性的、甚至是致癌的。

2.6 关于CE认证 和SGU控制器一起安装在AVANCE中的所有主要硬件单元和外围的HPPR、匀场系

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2 安全注意事项 统、探头、BSMS键盘单元都符合CE认证。这涵盖了电磁辐射水平以及普通的电子伤害指标。注意,如果想使电磁辐射泄露量最小,应该关闭机柜的门,并且挂上后面板。 (CE认证:在欧洲经济区市场上销售的商品中,加贴CE标志的商品表示其符合安全、卫生、环保和消费者保护等一系列欧洲指令所要表达的要求。CE:CONFORMITE EUROPEENNE——译者注)

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3 理论及术语说明

3.1 简介

NMR是一项用来分析化学分子(主要是有机化合物)结构的技术。典型的化合物由碳、氢和氧原子构成。

最简单的情况下,一个NMR实验由三个步骤构成: 1. 将样品放置在静磁场中; 2. 使用射频脉冲激发核子; 3. 测量样品放射出的信号的频率。

图3.1 激发与响应

通过分析样品放射信号的频率,可以得到样品中关于原子结合和排列的信息。NMR激发样品时,核子在不同的频率(称为“谐振频率”)产生谐振。这些频率就是核子被外来射频脉冲激发而发射出的频率。谐振频率的值取决于两个参数:

A)原子核的类型:

每种同位素的原子核都由特定数量的质子和中子构成。原子核的结构最大程度决定了谐振频率的值。每种同位素表现出一个“基础谐振频率”。碳13核的基础谐振频率不同于氢1等核的频率。注意表3.1中列出的不同同位素基础谐振频率之间的不同。

表 3.1 不同同位素数据表

以11.7T磁体为例

原子核 NMR 效应 基础谐振频率[MHz]

(近似值)

1

自然丰度[%]

H 有 500 99.98 中文版 003

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3 理论及术语说明 2

H H C C

有 有 无 有 有 有

77 0.015 533 0.005 --- 98. 126 1.11 49 75.53 41 24.47 3

12

13

35

Cl Cl

37

b) 原子所处环境:

在基础谐振频率之外,同位素原子所处环境也会影响核磁共振频率。1H核磁共振频率的准确值取决于它和什么原子结合,以及被什么原子包围。原子核被电子包围,可以把电子看作带磁场的运动电荷,这些电子是原子核被磁屏蔽的一个原因。屏蔽的范围取决于原子所处的环境。

同位素类型和样品所处的磁场强度决定了本地场强位移(会导致相应的频率位移,即化学位移)的典型值。下表列出了两种最常用的NMR核(1H和13C)的频率位移典型值。可以清楚的看出原子所初环境对其基础谐振频率有一些影响。

表 3.2 频率位移 (以11.7T磁体为例) 原子核

1

所处原子环境引起的基础谐振频率位移值 6 kHz 100 kHz

H C

13

NMR信号一般被绘制成波谱,分析频率和强度之间的关系。在NMR波谱中,频率通常作为水平轴并向左侧增大。

图 3.2 NMR 波谱

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U3.2 氯仿的NMR分析

综上所述,频率变化的定性信息取决于原子核所处的原子环境。信号的积分强度代表了对信号强度的测量,通过对信号峰下的区域进行积分取得。如果所有原子核都被同等激发,那么积分值与贡献特定频率的原子核数量成正比,从中可以得出关于化学结构的定量信息。 在NMR实验中为了激发指定的原子核,激发脉冲的频率应接近原子核的基础谐振频率。这个频率被称为载波频率(carrier frequency)。那么,如果实验使用11.7T的磁场,那么113H核将需要大约500MHz的载波频率,C核需要126MHz的载波频率。载波频率被定义为参数SFO1。被载波频率激发的原子核被称为观察核(observe nucleus)。

请注意,在一些实验中将有多于一种的原子核被激发,例如polarzation transfer或者去耦实验。在这种情况下,将会出现多个载波频率,但是还是只有一种观察核。

并不是所有的同位素都可以响应射频脉冲,或者说,具有NMR效应。自然界中存在三

123H(氢)、H(氘)、H(氚,放射性元素),他们的自然丰度分别为99.98%、种氢的同位素:

0.015%、0.005%。三种都具有NMR效应,但是在表3.1可以看出,它们的谐振频率有很大的差距。在分析样品中氢元素时,只有1H被激发,因为这种同位素的丰度最大。自然界发现的碳同位素中,只有一种具有NMR效应。丰度最高的12C (98.%)没有NMR效应,因此,

13

C的自然丰度只有1.11%。显而易对有机物中碳元素的NMR分析只能依赖13C发射的信号,

见,对碳的NMR分析比其他元素更困难,比如氢(还有另外一些因素影响灵敏度,这些因素将在本章的下一节讨论)。通过以上对NMR的简要介绍,做为练习,我们来看看如何使用这项技术来分析氯仿的结构(CHCl3)。

3.2 氯仿的NMR分析

如下图所示,针对三个可能的观察核1H、13C、35Cl可以执行三个分离的实验。 图 3.3 CHCl3的NMR分析

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3 理论及术语说明

三个具有适当载波频率的激发脉冲E1、E2、E3将直接作用在样品上。E1符合1H的谐振频率,E2符合13C的频率,E3符合35Cl的频率。假如三种原子核都被成功激发,样品将发射出三个频率信号f1、f2、f3,信号会被记录在三个分离的频谱上,如果将发射信号显示在同一张图里,用户可能会期待一张如图 3.4 的频谱(注意图中标注的频率是在11.7T磁体中测得,所有信号都被画成单谱线,也就是单峰)。

图 3.4 CHCl3发射的NMR信号

这个人造谱图显示的三个峰对应同位素。通过计算三种同位素的数目,我们可能认为氯、氢和碳峰的强度之比为3:1:1。当然,三种同位素的自然丰度(参见表 3.1)也应该计算进去,比例为227:100:1。但是,用户会发现实验测出的信号峰强度的比值并不等于这些值。原因是因为每种同位素,对于NMR技术,都有一个固有的灵敏度。1H的灵敏度比13C高63

倍。也就是说,如果有一个样品含有同等数量的1H和13C,那么1H的信号强度比13C强63倍。如果象图 3.4这样描绘频谱,所有细节都丢失了,精确的分辨特定频率是不可能的。这

样的频谱被认为分辨率(resolution)非常差。(频谱的水平方向分辨率是指对两个相邻频率信号的区别能力)。

竖直方向的缩放比例的巨大范围使情况更加复杂化。对NMR灵敏度固有的差距,加上自然丰度的不同,使的经常很难把不同种同位素的信号画在同一张图上。事实上,谱图竖直方向的分辨率将会非常差。(竖直方向分辨率,也就是信噪比,是灵敏度测定的一方面)。 我们对氯仿的分析越来越复杂,这是因为我们尝试在一张谱图上对比三个不同观察核的信号。(在这里,我们忽略了所有硬件/电子方面的)。因此,在实践中,NMR实验只针对单个观察核进行。虽然,同时被激发的不止一种同位素,通过使用一种以上的载波频率(例如去耦实验),我们只观察一种同位素发射出的信号。这样大大简化了频谱分析。

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U3.3 标样,赫兹,ppm 上面提到,由于原子所处环境所造成的位移相对基础谐振频率来说是很小的。那么不能采用大的频谱范围。此外,自然丰度和固有灵敏度对特定同位素是不变的,那么同一频谱中1

H同位素发射的两个信号相对强度只决定于贡献该信号的原子数目。这大大简化了对频谱定量信息的分析。在进入对NMR更详细的描述之前,读者应该熟悉使用参考信号的ppm(百万分之一)来测量信号的概念。

3.3 标样,赫兹,ppm 我们已经确定了对NMR信号的分析要从两个方面进行,强度和频率。绝对频率的测量采用赫兹(Hz——周每秒)或者兆赫兹(MHz)。如果所有的频率测量都采用相对于参考频率的方式表示则可以简化测量信号的表达。在1H NMR实验中,推荐作为参考的是一种被称为tetramethylsilane(四甲基硅烷,TMS)的化学制品。当一个1H或者13C频谱被采集时,TMS的存在产生一个容易辨认的单峰。把这个峰的位置定义为零,那么其它峰的频率通过其与TMS峰的相对值给出。这样,我们可以说一个信号的频率是TMS峰以上2.5kHz。更可取的办法是引用信号的绝对频率,比如500.1325MHz。

相对于TMS峰的信号表示方法明显缩短了描述信号频率的数字位数。可是如果使用ppm替代赫兹作为单位,会更加简单。单位ppm表示由磁体场强决定的绝对谐振频率的一个分数,它的优点是频率测量值与磁体场强无关,这样就大大简化了不同频谱仪采集到频谱之间的比较。

从赫兹到ppm的变换方法和反变换方法如下图所示。 图 3.5 把赫兹变换成ppm

使用ppm单位的优点最好通过实际的例子来说明。假设在TMS以上2.5kHz观察到一个1

H信号,载波频率(SFO1)为500MHz。所有NMR信号的频率正比于磁体的强度。同一个信号,在600MHz谱仪中将出现在TMS以上3.0kHz,在400MHz机器上为TMS以上2.0kHz。一个简单的换算可能不算太复杂,但是每个系统的每个峰都要换算。现在来看一下采用ppm表示同一个信号。

频率(赫兹)除以SFO1(兆赫兹)=频率(ppm) 例如:

2500Hz / 500MHz=5ppm

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3 理论及术语说明 3000Hz / 600MHz=5ppm 2000Hz / 400MHz=5ppm

现在1H信号可以认为处在TMS峰以上5ppm,也就是说“前场”(downfield),与谱仪的频率无关了。有经验的用户将总是使用ppm,并且科学刊物出现的谱图的水平方向都使用ppm为单位,而不是赫兹。读者应该意识到在上面的例子中一些地方作了简化,500Mhz谱仪中1H的载波频率不是刚好500MHz,使用ppm时应该采用参数SFO1的精确值进行换算,同样在600MHz和400MHz谱仪上,1H的载波频率也不是刚好600MHz和400MHz。注意,一个正的ppm值表示一个比TMS频率高的信号频率,而且被定义为TMS的“前场”。

3.4 质子NMR——化学位移 1

由于1H是NMR试验中最常被观察的同位素,我们将对其进行详细讨论。H原子核中只包含

一个质子,因此观察1H核的频谱一般被称为质子频谱。前面提到,质子在11.7T磁场中表现出大约500MHz的基础谐振频率,而且精确的谐振频率由其所处的原子环境决定。氯仿分子中质子的谐振频率与苯分子中的质子会存在微小的差别,质子发射的频率信号可以标示出与其相邻原子结构的定性信息。这就是NMR的基本原理。

谐振频率准确值的细微差值被称为“化学位移(Chemical Shift)”。谐振频率由于相邻原子的影响而变动,更详细的说是由于早先提到的周围电子云的磁屏蔽。化学位移的测量,通常以TMS峰作为零点,以ppm为单位表示其相对于TMS峰的位置。

绝大多数质子,无论它存在于哪种有机物中,其化学位移都在TMS峰14ppm以内。 图 3.6 有机物中1H的化学位移

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U3.5苯的质子频谱 图 3.6 展示了有机物中常见质子化学位移。

3.5苯的质子频谱 下图是苯环的结构图。 图 3.7 苯环

所有六个质子(图中Ha)可以看成是相同的。它们每个与一个碳原子单键相连。每个碳原子与相邻的碳通过芳香键连接成为环状结构。因此,六个质子中的每一个都处在相同的化学环境中,也就是“化学等价”,或者说“磁学等价”。它们的谐振将精确地发生在f1频率,互相之间没有耦合。因此,对纯苯我们只能观察到一个信号峰。下图是溶解在氘代丙酮中苯的频谱,可以看到这个信号出现在7.5ppm。

图 3.8 苯的频谱

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3 理论及术语说明

3.6 乙酸苄酯(Benzylacetate)的质子频谱 乙酸苄酯(C6H5-CH2-O-CO-CH3)是一种更加复杂的有机物,下图是它的结构图。 图 3.9 乙酸苄酯

我们可以区分出三组质子,并分别标示出。标为Hb的三个质子所处的原子环境明显不同于标有Hc的两个质子。

三个Hb质子连在碳原子Cb上,Cb与另一个碳原子Ca通过单键相连。两个Hc质子连在碳原子Cc上,Cc通过单键分别与苯环和一个氧原子相连。第三组质子由苯环本身的五个质子Hd组成。图 3.10 是溶解在氘代丙酮中的乙酸苄酯的频谱。我们可以认为,谱图中的三个信号分别对应三组质子。

图 3.10 乙酸苄酯的质子频谱

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U3.7 带自旋/自旋耦合的乙基苯质子频谱

注意苯环上质子信号的位置由7.5ppm(图 3.8)移动到大约7.2ppm(图 3.10)。 苯环上的质子不再磁学等价,一些甚至不是化学等价,它们被分别标示。在图 3.10中,可以清楚地看到Hd质子形成的峰是一个多重峰,具体细节将在下一节提到。图中的三个质子峰的强度明显不同。

对这个频谱的定量分析相对简单,因为所有的信号都是同一种1H同位素发出的,例如,每个峰所对应同位素的自然丰度、对NMR技术的固有灵敏度都是相同的。因此,苯、CH2、CH3峰下的区域应该是5:2:3,与对应的质子数相等。

3.7 带自旋/自旋耦合的乙基苯质子频谱

到目前为止,对质子NMR频谱的描述都被大大简化了,把所有的峰都看成了单峰,除了乙酸苄酯中苯环上质子产生的峰。乙基苯的结构及对应的质子频谱分别在图 3.11和图 3.12中给出。和上面一样,质子被根据所处的三种原子环境标示为三组。

频谱中信号与乙酸苄酯最明显的区别就是信号成了多重峰。CH3的信号是一个三重峰,CH2的信号是一个四重峰。另外,需要注意信号的位置也不一样。乙酸苄酯中的CH3的信号在1.85ppm,乙基苯中的CH3的信号在1.25ppm。这一点也不奇怪,因为两个CH3集团处在不同的化学环境中。

多重峰形成的原因是由于一种被称为自旋-自旋耦合(spin-spin coupling)的影响。对这种效应的介绍超出了这本手册的范围,读者可以参考一些标准的NMR手册。一个对自旋-自旋耦合的简要介绍就可以满足我们的目的。

图 3.11 乙基苯

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3 理论及术语说明

图 3.12 乙基苯的频谱

图3.11中NMR信号的是由于相邻质子间的磁相互作用。两个Hf质子是磁学等价的,互相之间没有相互作用。同样的,三个He质子间也是磁学等价,互相之间也没有相互作用。但是,两个Hf质子和三个He处在不同的环境中,通过它们的共用电子互相“耦合”。耦合的直接结果就是两组质子互相影响,导致了NMR信号的。

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U3.8 去耦 两个Hf质子可以联合导致三种可能的磁场状态。(这是由于自旋具有方向导致的,术语称为自旋-自旋耦合)。耦合的结果是,He质子发射的NMR信号在三个可能的频率谐振,观察到一个三重峰。

同样的,He质子的影响使Hf的信号。三个He质子可以联合导致四种可能的磁场状态。因此,Hf质子有四个可能的谐振位置,信号也因此成四重峰。

苯中质子的信号也由于磁学不等价及由此产生的自旋-自旋耦合而。问题是为什么乙基苯中的CH2和CH3上的质子相互作用,而乙酸苄酯中的两组相似的质子却没有这种作用。答案在于把两组分开的化学键。在乙基苯中(图3.11)两组质子连接在两个相邻的碳原子上,可以充分的发生相互作用。但是在乙酸苄酯中(图 3.9),两个碳原子Cc和Cb之间,存在氧原子和另一个碳原子的连接。这样,由于两组质子相距太远,就无法表现出明显的自旋-自旋耦合。

3.8 去耦

自旋-自旋耦合的影响可以通过一种称为“去耦”的技术消除。去耦的作用是掩盖一组特定质子的存在,例如图3.11中的He质子。一个好像不存在He质子的频谱!这是通过发射一个去耦脉冲序列,这个脉冲序列的频率和He质子谐振频率相同,来持续改变这些质子的自旋方向。根据图 3.12这个去耦频率是在TMS峰以上1.25ppm。

去耦脉冲比激发脉冲,时间更长,能量更低。图 3.13是一个去耦试验的演示,图 3.14是去耦后的频谱。CH2四重峰现在变成了单峰。专家们称之为四重峰合并成单峰。而且,单峰下的区域应该等于原来四重峰下的区域。(注意比较两幅图中CH2和苯环峰的相对高度)。CH3组质子的信号在去耦频谱上消失了,这时因为,去耦脉冲有效地消除了CH3质子存在的影响。

图 1.3 去耦实验

图 3.14 同核去耦的乙基苯质子频谱

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3 理论及术语说明

上面描述的实验是一个同核去耦的例子,其中被观察和被去耦的是同一种同位素——1H。异核去耦是指被观察同位素不同于被去耦同位素的情况。在这本手册的 “去耦13C频谱” 章节,将执行一个异核去耦的实验,在去耦1H的情况下观察13C。

带有SGU的AVANCE谱仪根据安装的通道数可以具有执行非常复杂的实验的能力。一个四通道谱仪可以观察一种原子核,同时去耦其他三种原子核。如果具有八个通道,那么可以执行的实验的范围将更加令人惊异。用户应该注意,现在的瓶颈并不在于RF激发脉冲和去耦脉冲的发生,而在于如何通过探头和前置功放传输这些脉冲。

实验中采用的信号路由可以通过“edasp”菜单来设定,参阅“谱仪参数 adasp”

3.9 FID和频谱 样品中被激发的原子发射出的信号被谱仪接受并进行傅立叶变换。接受NMR信号的过程被称为采样,即采集数据。两个术语应该被区分开:“FID”(时域)和它相关的“频谱”(频域)。

当执行一个采样时,“原始”数据被采集,被接受到的信号被称为FID(自由感应衰减Free Induction Decay)。典型的FID如下图所示。

图 3.15 傅立叶变换

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U3.9 FID和频谱

只有在被变换成频域信号后,才能对FID进行有用的分析。这需要使用“ft”命令来完成傅立叶变换。傅立叶变换是一种数算,可以把FID转化成频率谱图。FID是信号强度随时间变化的表示方法,频谱表示的是各个频率的强度。傅立叶变换是几种常用的原始数据处理方法中最重要的一种。

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4 系统介绍

4.1 简介

谱仪由下面的子单元组成:

操作控制台包括计算机主机、显示器、键盘和BSMS键盘1。 机柜包含电子硬件。

磁体系统包括匀场系统,前置功放(HPPR)和探头。 图 4.1 操作控制台、机柜和磁体系统

1 BSMS键盘是一些系统的可选配件。

4.2 操作控制台及其连接

谱仪的所有操作动作都由操作控制台控制。即实验的设计和执行以及数据的分析都由操作者输入控制台的命令控制。操作控制台的组成如下:

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4 系统介绍 计算机主机:一台个人计算机。主机运行Topspin程序,负责所有的数据分析和存储。和数据采集相关的所有操作由另一套安放在机柜内,被称为采样控制系统(AQS)的计算机系统控制。

主机与AQS的以太网连接:它被用来在主机和AQS之间传输数据和指令。

主机与AQS的RS232连接:这个串行接口是连接到主机的替代方案(相对于以太网)。注意这个RS232连接并不是操作必须的,因为信息是通过更快的以太网连接传输的。但是它对于在以太网连接失效的情况下排除故障是相当有用的。

BSMS键盘:这个(可选)设备可以让用户控制锁场和匀场系统及一些基本操作,例如放入、旋转和取出NMR样品。

BSMS键盘到BSMS CPU的连接:键盘被连接到安放在机柜内的BSMS CPU板上。如果BSMS被关掉,那么需要重新建立连接。在这个过程中,键盘的显示器将出现提示信息“booting”和“connecting”。如果没有错误提示信息,可以确认连接已经建立。

4.3 机柜

在不同的系统中,这个单元可能是单柜或者双柜,它容纳了一台现代数字谱仪相关的大部分电子硬件。主要单元有AQS(采样控制系统 Acquisition Control System)、BSMS(Bruker自动磁体系统 Smart Magnet System)、VTU(控温单元 Variable Temperature Unit)和各种功放。

AQS:AQS内的各个单元分别负责发射激发样品的射频脉冲,并接收、放大、数字化样品放射出的NMR信号。当数据被接收和数字化后,信息被传输到主机进行进一步的处理和储存。和主机的连接主要是通过CCU(通讯控制单元 Communications Control Unit)。这里重点强调,在实验进行期间,AQS完全控制谱仪的操作,这样可以保证操作不间断从而保证采样的真实完整。机架上有一系列数字和模拟的插槽板卡,它们负责发生需要的RF信号和接收、放大并数字化NMR信号。对这些板卡的详细描述超出了本手册范围。

BSMS:这个系统可以通过BSMS键盘或者软件进行控制(“bsmsdisp”命令),负责操作锁场和匀场系统及样品的升降、旋转。

VTU:根据样式,VTU可以是一个分离的单元或者被合并进BSMS。它的功能是通过可控制的方式改变样品的温度或者保持温度恒定。

功放(也被称为传输器):激发NMR样品需要相对大的信号振幅,这就需要功放的参与。功放可以是内置的(合并在AQS机架内)或者外置的(分离的单元)。从功放输出直接到HPPR的电缆把RF信号传给样品。虽然有很多种功放(包括固体功放),两个主要类别是:

选择性功放(Selective Amplifiers也被称为1H或质子功放)是专门设计用来放大1H和19F的高频信号。

宽带功放(也被称为X功放)被设计用来放大宽范围内的频率信号(除了1H和19F)。 RF能量通过标有“Rf in”的SMA接头输入功放。这是一个最大振幅为1Vpp的弱信号。但是这个信号的品质是至关重要的,它决定了最终信号的频率、时基(timing)、形状和相位。很多有经验的用户可能希望在一个示波器上监视这个信号。功放的功能是取得输入信号并对其执行确

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U4.4 主机与AQS间的连接 定倍率的放大。功放的放大倍率由SGU事先传给功放的参数pl0-pl31控制。功放输出的RF信号可以达到数百伏的电压,不推荐在没有接入衰减器的情况下,使用示波器进行查看。

4.4 主机与AQS间的连接 在一般的Topspin进程中,这个连接一直工作在用户后台,无论主机还是AQS被关闭都会中断,再开机需要重新进行连接。

站在用户的角度,最好把AQS看成另一台计算机。这台计算机由于最靠近谱仪硬件,通常被称为“spect”。

在重起AQS之后,可以登录到spect。这通常是通过连接在tty00的RS232连接物理登录到AQS的CCU单元。这个界面可以通过点击主机桌面上的CCU超级终端图标调出,或者是通过Linux外壳。注意你还可以使用命令“telnet spect”通过以太网连接进行访问。如果你能成功登录到“spect”,可以确认AQS已经启动,而且主机与AQS间的连接通讯正常。

在“常见故障排除”这一章将描述开关谱仪的流程及原理。

4.5 磁体、匀场系统、HPPR和探头

磁体产生NMR跃迁所需的磁场。为了维持这个超导系统,磁体的核心被液氮和液氦冷却到非常低的温度。(更多细节参见“磁体和磁体杜瓦”)

室温匀场系统,被安装在磁体的下端,是一组载流线圈(称为匀场线圈),通过补偿磁场不均匀度来改善磁场一致性。室温匀场线圈(这样称呼是因为它们没有被浸入液氦中进行冷却)中的电流由BSMS控制,并可以通过BSMS键盘调整来优化NMR信号。这是影响信号分辨率和灵敏度的主要因素。调整室温匀场线圈电流的过程被称为磁体匀场。

图 4.2 磁体、匀场系统、探头和HPPR的照片

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4 系统介绍

虽然HPPR(高性能前置功放)可以把RF信号传给样品,但它的主要功能是放大样品放射出的微弱信号。它被安置在磁体的旁边,以尽可能早对NMR信号进行放大,来减小在电缆传输中的衰减。一旦信号在HPPR中经过放大,后面在电缆中的衰减就不会再有很大影响。另外,HPPR还传送和接收氘(或者氟)锁场信号,并被用在wobble程序中。

最多可以配置5个(HPPR)或者8个(HPPR/2)模块(不包含封面模块Cover Moduale)并自动显示在“edasp”窗口内。最普通的配置由三个模块构成,质子、X-BB和2H,再加上封面模块,如图4.3所示。2H模块用来传输和接收锁场信号。HPPR模块到探头和功放的连接方法如图4.6所示。对HPPR技术关注的重点是被称为发射/接收切换的工作方式。一旦发射信号通过,信号通道就被用来放大接受到的信号,大约30dB。关键就在要尽可能快地切换来防止遗漏,这样,发射信号才不会淹没接收信号。

图 4.3 由三个模块加封面模块构成的HPPR

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U4.6 磁体和磁体杜瓦

探头被插在磁体底部的匀场系统中,它本质上还是由各种线圈组成,负责发射激发脉冲到样品和接受放射出的信号。探头还发射和接收锁场信号。

4.6 磁体和磁体杜瓦 不同的磁体具有不同场强,磁体的强度根据氢原子放射出的NMR信号的频率进行分级。磁体越强,氢频率越高。例如,500MHz磁体(11.7T),这意味着,当把一个化学样品放入磁体进行分析时,样品中的1H原子将放射出一个非常接近500MHz的频率信号。Bruker的磁体在200-900MHz之间。

超导磁体是电磁体,是利用电流产生一个磁场。磁体核心是一个由载流线绕成的很大的螺旋管,在线圈的中心存在非常强的静磁场,样品就是被放在这个磁场中进行分析的。

某些材料在极低的温度下会表现出显著的超导电性。超导线传输电流不需要任何驱动能量(电池或者主电源)。一旦超导环中产生电流,将永远持续。Bruker磁体就是使用了这么一个超导环。在磁体第一次安装时,主线圈中会被输入电流。这被称为磁体“充能”(升场)。当升完场后,磁体将可以保持现状工作很多年,一旦开始,永不结束。磁体需要的唯一维护就是要确保超导线圈保持在极低的温度。

氦气的沸点是4K(-269℃),正常情况下,在4K以上,它是气态,4K以下,成为液态。那么,如果把线圈浸在液氦中我们可确定其温度在4K或以下。这样的温度可以保证磁体线圈保持超导。但是,当大量的液氦蒸发掉时,超导线圈的一大部分不再被液氮覆,超导线圈的温度将升高,达到一定温度就会失去超导电性。线圈的电阻会导致磁场突然衰减,同时产生的热量会很快

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4 系统介绍 地蒸发掉大量液氮和液氦。放置磁体的房间瞬时间会被蒸发的气体充满,这被称为磁体“失超”。这可能会,也可能不会对磁体造成永久伤害,无论如何,重新升场都会耗费大量时间和金钱,因此在任何情况下都要尽力避免这种事情。磁体技术棘手的地方在于如何保证覆盖磁体线圈的液氦尽可能少的蒸发。这需要减少从NMR实验室(室温)到磁体核心(4K)的热传递。磁体由几部分组成。磁体的外层抽成了真空,内表面镀上了银。(这和热水瓶的保温原理相同)。紧接着液氮腔把温度降到77.35K(-195.8℃),最里面是浸泡着超导线圈的液氦腔,它和液氮腔通过另一个真空腔进行热隔离。(参见图4.4 超导磁体)

4.6.1 室温腔管

液氦和液氮腔被设计安装在一个被称为室温腔管的中心圆柱周围。一般会有一个金属盖封住腔管的上口。磁体分为标准腔和宽腔两种。需要进入磁体的样品通过腔管的上口放入。负责保持样品位置和传递样品信号的探头,从下口插入磁体。

4.6.2 液氦腔

标准磁体的液氦腔悬挂在两个高高向上伸出磁体的颈管上。两个管口进入液氦腔。其中一个可以用来充装液氦,同时也是液氦高度传感器的入口。另一个管口只有在升场和降场时使用。颈管上还连接着一些阀门,来控制释放不可避免蒸发出的气体,系统管理员应该确认这些阀门在正常工作,也就是没有被冰堵住。

绝对不要让液氦管口长时间打开(超过30秒)。

液氦的高度可以手动或者电子检查。手动检查要使用一根长长的计量管(dipstick)从一个管口插入液氦腔(仅限于有经验的用户!)。使用BSMS键盘可以调出液氦高度的电子监测数据,详细参见“BSMS功能”一节。

图 4.4 超导磁体

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U4.7 锁场系统简介

4.6.3 液氮腔

磁体上方伸出的三个较短的颈管通往液氮腔。使用合适的计量管可以通过三个管口中的任意一个检查液氮的高度(仅限于有经验的用户!!!),如果需要还可以标出该高度。再次强调,系统管理员应该定时检查连接在液氮腔管口的所有阀门,确认它们没有被冰堵住。

上面提到,磁体的设计是为了减少液体的蒸发。正常操作中,每天都会有少量的液氮蒸发。这是完全正常的,事实上,如果液氮不再蒸发,那么一定是液氮管腔口被堵住了。磁体的大小和设计决定了需要多长时间测定一次液氮和液氦的高度。每周检查和测定液氮的高度是个好习惯,如果能同时检查并记录液氦的高度也是个好习惯。虽然液氦的蒸发速度远远少于液氮,液氦的充装间隔也更长(3-6个月),但是定期的检查可以确认液氦的蒸发速度没有改变。

4.7 锁场系统简介 这一部分将使用户对锁场系统工作原理有一个的基本了解。诸如“实践中如何去锁定一个样品”的实际问题将在“样品锁定”一节讨论。

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4 系统介绍 锁场系统的目的是保证样品周围的磁场不会由于漂移或者受外界信号干扰而改变。NMR分析需要测定样品放射出信号的频率精确值,这些信号的频率直接决定于磁场的强度,也就是说,如果场强改变,放射信号的频率也跟着改变。因此,用户需要确信磁场强度总是精确的维持在同样的强度,这被称为“锁定”样品。锁场系统本质上是一个被设计用来观察氘的谱仪。应该提及,氘放射出的信号的频率通常离我们感兴趣的信号很远,但是如果氘的信号不合适,这时就要使用氟锁。由于氘锁的应用范围最广,这里指对其进行讨论,读者应该注意氘锁和氟锁的工作原理是一样的。

在带有SGU得AVANCE系统中,BSMS提供了实现锁场所需要的硬件,HPPR中一个的氘模块负责发射和接收锁场信号。分析的样品中当然也必须加入一些氘元素。通过把样品溶解在氘代试剂中,可以很容易做到这一点。氘代试剂中很大比例的氢原子被氘原子取代。常用的氘代试剂有氘代丙酮、氘代苯和氘代氯仿,还有很多其他溶剂可以使用。这本手册在阐述NMR技术时,使用的样品就是溶解在氘代氯仿中的cholesterylacetate。

特定磁体中氘信号的频率的精确值是已知的。那么,如果磁体的强度是正确的,那么样品中氘原子放射出的信号就应该是这个频率。如果场强改变,氘频率也会改变。锁场系统使用一个接收器(安装在BSMS机架中)来监视氘频率并据此调整磁场强度。

锁场系统的接收器被设计当场强正确时(检测到正确的氘频率),不调整磁场。一旦当场强改变(漂移),磁体匀场系统中的一个特殊线圈(H0线圈)中的电流就会改变,从而使场强回到正确的值上。由于氘的频率每秒被测量数千次,当系统被锁定后,用户可以认为采样期间的场强是常量。

4.8 探头

探头的功能是支撑样品,发射激发样品的射频信号并接受响应信号。发射和接收过程使用了特别设计的RF线圈。

探头被插入到磁体的底部,位于室温匀场线圈的内部。同轴电缆把激发信号从控制放大器传送至探头,并把NMR信号从样品处传回接受器。电缆需要经过靠近磁体旁边放置的一组前置放大器(HPPR),这是由于NMR信号一般非常微弱,需要前置放大器对其进行放大。

图 4.5 探头中的样品

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U4.8 探头

探头发展出不同的规格和类型。探头的规格区别在于它能支撑的样品管的规格不同,5mm和10mm直径的样品管最常见。探头的类型区别在于能进行的实验类型不同。选择性探头可以观察特定的原子核,例如13C;多核探头(X-BB或者宽带)可以分析一个宽范围内的原子核。内部线圈的数量和设计从物理上决定探头的类型。另外,探头的外径和长度依据不同磁体的参数制造(宽腔或标准腔;不同场强的磁体磁场中心距磁体底部的不同长度)。

信号通过探头下部的接头进入和离开探头线圈,接头都有清晰的标示。信号通过同一根电缆进出探头。每个探头都有一个内线圈(观察线圈)。这个线圈处于最接近样品转子的位置以增大灵敏度。内线圈BNC接头的颜色编码有一个简单的规则。它总是和BNC接头上方的矩形图章颜色相同。下图是一个多核探头的标示,这种情况下,宽带线圈是内线圈。

图 4.6 典型HPPR连线

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4 系统介绍

4.8.1 双模13C/1H探头

作为典型探头的一个例子,这里介绍双模13C/1H探头。从它的名字可以看出这种探头是为那些对分析样品中碳和氢特别有兴趣的用户设计的。

左边标有2H的BNC接头(参见图4.7)是传输氘锁信号的。另外两个接头,根据它们的标示,传输1H和13C信号。从1H、13C和2H BNC接头引出的电缆连接到磁体旁边的HPPR。

图 4.7 双模13C/1H探头

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U4.8 探头

在现代NMR中,探头的设计可以使NMR样品的温度得到控制。可以插入一个加热器,配合空气/氮气传输管,来控制样品的温度。一个热电偶温度计负责监视样品的温度。所有这些设备都连接在探头的下面,很容易操作。变温单元(VTU,Variable Temperature Unit)监视热电偶的读数并调节加热器的功率来维持需要的温度。

最后,在探头的下面有几个标有T(调谐)或者M(匹配)的可调螺丝。通过它们可以微调探头来优化性能。在对化合物进行分析时,需要使用特定频率(谐振频率)的信号对其进行激发。不同核需要使用不同的频率激发,这需要调整探头内部的电路以获取对关注频率的最大灵敏度。同时需要对探头进行匹配,尽可能减少激发信号和FID的反射(浪费),调谐和匹配是相关的,不能分开进行。

如果是有机溶剂的常规实验,如果探头已完成初始化调谐和匹配,每周甚至每月检查一次这些设置就可以了。无论如何,如果要使用谱仪进行更高水平的试验,每次更换磁体中的样品后都应该重新调谐和匹配探头。使用“wobble”程序,分别调谐探头中的每组线圈,具体描述参见“调谐及匹配探头”。对于图 4.7中的双模探头,可以看见不同颜色编码的1H和13C调谐和匹配螺丝。

更换探头将需要重新连接HPPR和探头,但是HPPR到机柜的连线一般是不需要动的。

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4 系统介绍 4.8.2 更换探头

如果需要更换探头,应该按照以下步骤进行。探头是易碎而且昂贵的,所以在尝试更换探头之前先和系统管理员联系确认。磁体,确切的说是探头在磁场内运动时产生的涡流电流,对探头的机械运动有很大影响。当从磁体中取出探头时,注意当它接近磁体管的下端时会突然加速,当把探头放入磁体时也会遇到一些阻力。

更换探头的步骤:

1. 确认采样程序没有运行。点击Topspin窗口上面工具栏中的命令行输入stop或者halt。

2. 关闭系统中的加热或冷却。使用“edte”命令来关闭加热器并设置气流量为零。等待探头平稳恢复至室温。不要关闭系统本身。

3. 如果有空气/氮气气管连接到探头底部,取下。

4. 确认室温腔管没有盖着,按BSMS键盘上的LIFT键取出磁体中的样品。 5. 关闭LIFT。

6. 从探头基座上取下所有BNC连线。

7. 取下热电偶,加热器(如果有),梯度或者PICS连线。 8. 拧松两个金色的螺丝,使探头从磁体上分离。 9. 竖直下移探头直至离开磁体。 10. 插入新探头并拧紧两个金色的螺丝。

11. 重新连接同轴电缆,热电偶,加热器或者冷却线以及其他取下的连线。 12. 打开加热器。

或者

,或者在

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5 NMR样品

5.1 简介

在使用NMR技术研究固体时,信号很粗糙,反映不出来科学家最感兴趣的精细结构。因此,一般把固体样品溶解在合适的溶剂中进行采样。液体样品也是一样的。可能在有机溶剂中添加少量的参考成分。但是,如果要取得最好的结果,样品应该尽可能纯净。杂质的信号至少会使谱图很杂乱,甚至掩盖有用的信号。需要特别注意的是,样品中不能混有磁性杂质,否则会扭曲磁场降低谱仪的分辨率。固体杂质可以通过过滤除去。溶液中的杂质水可以通过在溶解样品前进行充分干燥除去。

5.2 溶剂选择 在样品充分提纯和干燥后,下一步就是选择合适的溶剂。由于氘是最常用的锁场核,样品一般溶解在氘代溶剂中(氘代溶剂是指溶剂中的大部分的氢,一般大于99%,被氘取代)。氘代溶剂有很多种,常用的有氘代丙酮(acetone-d6)、氘代苯(benzene-d6)、氘代氯仿(chloroform-d)。

在选择溶剂时需要考虑以下因素:

1. 溶解度:显然样品在溶剂中的溶解度越大越好。争取在同等体积内融进

最大量的样品,可以增大实验的灵敏度。当样品数量很少时,高溶解度就显得特别重要了。

2. 溶剂信号对样品频谱的干扰。溶剂自身不可避免产生的NMR信号也会出现在频谱区域。这些溶剂峰不应该和样品信号重叠。

3. 温度可靠:对于室温以上或者以下的实验,溶剂的溶点和沸点是重要的因素。另外样品的溶解度会随着温度而改变。

4.

粘滞性:溶剂粘滞性越小,实验分辨率越好。

5. 成本:显然日常的NMR实验有许多样品需要测量,样品的成本是一个必须考虑的的因素。首要的规则,氘代原子越多,价格越高。

6. 水含量:几乎所有的NMR溶剂中都有水的痕迹。由于许多溶剂都有吸湿性(它们从大气中吸收水),储存时间越长,水含量越高。水峰的存在会极大降低NMR谱图的质量。降低水含量有两种有效的方法,使用干燥剂进行过滤,使用分子筛储存溶剂。

特定样品的溶剂选择是通过折中每种溶剂的优点和缺点选择出的。关于溶剂的详细资料读者需要参考标准的NMR资料。

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5 NMR样品 5.3 样品管 分析样品时可以把样品旋转起来,根据实验的要求或探头的类型。旋转可以减弱磁场X和Y方向不均匀的影响,改善谱图的分辨率。旋转样品的一个缺陷是可能产生旋转边带。这些是假信号(假峰)是由于磁场以旋转频率周期变化而产生的。这些峰会出现在较强的真信号峰的两侧,间隔等于旋转频率。边带的强度正比于真信号峰的强度。如果旋转频率是20周每秒(=20Hz),那么你可以分别在真正的信号峰上下20Hz的地方发现边带。

图 5.1 带有旋转边带的谱图

旋转边带的存在是不可避免的,强弱取决于样品管的质量。理想情况下,样品管应该是完美的圆柱形。特别大的边带表明样品管的对称性达不到,应该换用更高规格的样品管(价格当然更贵)。 样品管必须保持清洁,避免沾染灰尘或划伤。不能使用试管刷刷洗样品管。注意新的NMR样品管并不一定是干净的。样品管可以使用丙酮或者蒸馏水清洗。使用洗涤液后必须立即冲洗干净,以免腐蚀样品管。还可以使用超声波清洗。如果以上方法都不行,那么可以把样品管用王水浸泡两天左右,在其干燥前进行彻底冲洗。NMR样品管可以进行烘干,但不能超过100℃,否则它会变形以至于无法进行旋转。干燥最好采用吹入干燥氮气的方法。

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U5.4 样品处理 5.4 样品处理 直接把NMR溶液过滤进样品管避免沾染灰尘和其他污物是个好习惯。可能的过滤品有

。拿住样品管时要拿住上部。 棉絮、玻璃纤维1或者硅藻土(助滤剂,寅式盐,celite)

1.注意当使用玻璃纤维时可能会出现问题,特别是测量T1值时。

一般步骤如下:

1. 对于固体样品,如果使用5mm样品管,可以在0.6cm3选定的溶液中最多溶进

。对于液体样品,如果观20mg样品(10mm样品管可以在2.5cm3溶剂中溶进80mg样品)

察质子,可以在80%体积氘代溶剂中溶进20%体积样品。

2. 添加少量(大约0.1%)参考化合物——四甲基硅(Tetramethylsilance,TMS)。确认TMS峰信号强度低于最强的样品或者溶剂峰(否则会降低接收器增益,使信噪比变差)。 3. 溶液经过填充干燥玻璃丝絮的巴斯德吸管(Pasteur pipette)的过滤后进入样品管。

4. 通过过滤器过滤出0.2cm3溶液,在样品管大约三到四厘米深的样品。

5. 盖上样品管,使用腊膜(parafilm)密封减少蒸发,并贴上标签。仔细使管盖、腊膜和标签同轴以免影响样品旋转。

将样品管插入转子的操作方法将在“在转子中插入样品”一节中讨论。

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6 实验基本步骤

6.1 简介 这一章将简要介绍每次采集频谱都要用到的一些基本操作。包括BSMS键盘操作,插入和旋转样品,调谐和匹配探头,还有匀场。读者如果已经熟悉这些操作,可以略过这一章。

注意:一些系统没有BSMS键盘,需要使用软件控制BSMS操作(“bsmsdisp”命令)。

6.2 BSMS键盘 BSMS键盘功能及其使用操作的全面介绍可以参阅BASH CD中的BSMS用户手册。这本手册的目的仅限于使用户获取BSMS键盘的基本操作知识。但作为参考,在“BSMS功能”一节中列出了BSMS键盘最重要的功能。

本质上讲,BSMS键盘被用来: 1. 操作锁场系统 2. 控制样品旋转和弹出

3. 调整室温匀场系统的电流(即“匀场”) 4. 监视磁体内液氦的高度

键盘有不同的几个版本,但是这里不讨论它们之间的区别(图“BSMS键盘(BOSS版)”中显示的是其中一个版本)。

警告:在开始之前,注意两个键的操作使用。 1.

液氦测量键(HELIUM MEASURE)最好不要碰,具体原因会在后面讨论(参

见“液氦高度功能”)。 激活弹出键(LIFT)之前确认室温腔管没有盖着。往磁体中放入样品之前,一定要激活弹出键,打开气流。

2.

在操作BSMS键盘之前,你可能需要保存一些被称为“匀场值”的重要参数,这些参数可以通过BSMS单元进行修改(参见“保存一组匀场值(wsh命令)”)。这样,你进行的任何调节都可以很容易地恢复。匀场值可以使用BSMS键盘下面三行标有代数符号的键(例如X、Y、XZ、X3等)进行调整。

图 6.1 BSMS键盘(BOSS版)

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6 实验基本步骤

6.2.1保存一组匀场值(wsh命令)

要保存当前匀场值,需要使用“wsh”(write shim file)生成一个匀场文件。 1. 在Topspin命令行输入“wsh”。出现一个显示现有匀场文件的窗口,一个输入长文件名的文本框,写入、查看、删除和退出按钮以及输入注释的文本框。

2. 输入任意文件名,例如 Monday 3. 点击写入按钮。

当前的匀场值就会保存在一个叫“monday”的文件中。读取“monday”可以恢复这些值,现在你可以使用BSMS键盘调整匀场值了。

6.2.2 读取一组匀场值(rsh命令)

1. 在Topspin命令行输入“rsh”。出现一个显示现有匀场文件的窗口,一个输入长文件名的文本框,读取、查看、删除和退出按钮以及输入注释的文本框。

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U6.2 BSMS键盘 2.

在文本框中键入“monday”或者在文件列表中进行选择,然后点击读取按钮。

BSMS键盘会闪动一会,当操作完成时,在屏幕底部会出现“rsh finished”的提示。

这样匀场值就恢复到原来的值了。

用户应该熟悉读取和写入不同类型文件的概念,这在接触到参数集时特别重要。如果你要保存一组参数,你可以把它们写到磁盘上。多个参数的值保存在一个文件中,这个文件有一个独特的文件名(用户可以选择),这样不同的参数集就可以进行区分了。如果以后你需要使用这些参数,只需要读取相应的文件就可以了。

6.2.3 BSMS功能

下面只讨论最常用的功能。更全面的信息可以在BASH CD中的BSMS用户手册第二章查到。

宽泛的讲,BSMS功能可以分为四类:样品控制功能,锁场功能,匀场功能和液氦高度功能。

6.2.4 样品控制功能

LIFT ON-OFF:LIFT ON会把样品管从室温腔管中吹起来。LIFT OFF会把样品管平缓地放进室温腔管,放置在探头的顶上。

禁止在盖着室温腔管时使用LIFT ON。

确认往室温腔管中放入样品管前打开气流,即激活LIFT键。

SPIN ON-OFF:开始/停止样品管的旋转。样品管旋转(如果被激活)会在LIFT OFF后20秒自动开始。

SPIN RATE:调整旋转的频率,单位Hz。

SPIN MEASURE:在屏幕右侧显示当前旋转频率,左侧显示设定值。两个值应该相等。

6.2.5 手动锁场功能

锁场系统的功能已经在“锁场系统简介”一节中讨论过。谱仪会锁定样品中氘放射出的NMR信号。这可以通过扫场(增加和减少磁体的场强)做到。在一个合适的场强下,氘原子会被在谐振频率激发,在锁场显示可以看到相应的信号。

操作分为两步。首先,样品周围的场强会改变,然后样品被锁定。下面介绍BSMS键盘上控制扫场和锁场的键。

SWEEP RATE:可以调整扫场的速度。

SWEEP AMPLITUDE:控制扫场中磁场强度变化的范围。

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6 实验基本步骤 SWEEP:打开/关闭扫场。系统锁场后会自动关闭扫场。

LOCK ON-OFF:激活后,系统会尝试锁定样品。绿色的LED会闪动几秒钟,系统锁定后该灯常亮。一般情况下只能在谱仪被锁定的情况下进行采样。

LOCK POWER:控制氘核激发信号的能量。

LOCK GAIN:控制锁场信号接收器的增益(灵敏度)。

有两种方法可以寻找锁场信号。一种是锁场频率不变,磁场强度改变,被称为“场模式”(field mode);另外的磁场强度不变,频率改变,被称为“位移模式”(shift mode)。 FIELD:锁场时,改变匀场系统中的Ho线圈电流可以使磁体场强在一个中心值上下变动。这个场强中心值可以使用FIELD键调整。默认情况下,BSMS系统处于场模式,这时这个键使用可以操作的。如果BSMS系统被设置成位移模式,那么FIELD值只能显示在键盘上,而不能调整。

LOCK SHIFT:锁场时,改变BSMS中的电路参数可以使锁场频率在一个中心值上下变动。这个场强中心值可以使用LOCK SHIFT键调整。BSMS系统处于位移模式时,这个键可以操作。否则,那么以ppm为单位的SHIFT值只能显示在键盘上,而不能调整。 AUTOLOCK:激活后,谱仪会尝试自动锁定,这个功能在自动实验时很有用。谱仪会自动调整Field值使锁信号居中。注意激活“Autolock”后,谱仪并不会考虑“edlock”表中列出的不同溶液对应的FIELD位移。

6.2.6 手动匀场功能

匀场值

显示屏下面标有代数式的按键可以调整匀场设置。这些键控制着磁体中匀场电流的大小,回顾“磁体,匀场系统,HPPR和探头”一节。匀场电流的设置对于谱仪性能非常重要,它们的调整会在“匀场”一节进行讨论。每一组写在磁盘上的匀场文件都保存有一组匀场值。

AUTO SHIM:激活后,程序会自动调整匀场值维持最高的锁线。Autoshim选择的匀场项是匀场振幅(shim amplitude)不为零的匀场项。注意autoshim只在需要对匀场值进行微调时有效。

6.2.7 液氦高度功能

HELIUM LEVEL:谱仪每24小时自动测量一次液氦的高度,并记录到默认目录下的日志文件。默认目录如下:

Windows 2000:C:\\Bruker\opspin\\prog\\logfiles LINUX:/opt/topspin/prog/logfiles

液氦高度以百分比表示(100=满)。按下这个键,最近两次高度记录会显示五秒钟(右边是最近的高度),不会进行测量。

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U6.3 将样品管插入转子 当液氦高度下降,低于一定值(依磁体类型而已)后,将会显示一个警告信息,这时必须马上补充液氦。

HELIUM MEASURE:进行一次12秒的测量。用户应该注意测量液氦高度的过程会导致一些液氦蒸发。因此HELIUM MEASURE不应该频繁使用。

6.3 将样品管插入转子

样品装在玻璃管里进行分析,样品管插在塑料转子里。定深量筒控制样品管插入转子的深度。确保样品与探头内的线圈对齐。定深量筒具有设置样品深度的分度刻度。 1. 对于5mm探头,根据刻度把白色塑料基座的位置放在中线(0mm线)以下18mm到20mm之间。对于10mm探头,把白色塑料基座的位置放在中线以下20mm处。 这只是推荐深度,你应该向系统管理员了解所用磁体和探头的准确深度。一旦你设置了正确的深度,就要一直使用这个值,这样可以减小更换样品后重新匀场的工作量。

2.

拿住样品管上部,把样品管放进转子,把转子放进定深量筒。

3. 轻轻把样品管往里推,使中线上下的样品一样多。如果样品量足够,那么可以把样品管推到刚好接触白色塑料基座。

4.

在把样品管和转子放入磁体之前,取掉定深量筒。

6.4 将带样品管的转子放入磁体 样品的升降是由一股压缩空气控制的。小心不要在盖着室温腔管盖的时候弹出样品。较新的BOSS-2匀场系统的设计,已经不允许在盖着管盖的时候激活LIFT键。同时在往磁体中放入样品前,确认存在气流(可以听到气流声)。

图6.2 把样品管插入转子

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6 实验基本步骤

将带样品管的转子放入磁体需要按以下步骤进行:

1. 取下室温腔管上的盖子。

2. 按下BSMS键盘上的LIFT键。可以听到气流的声音,这时如果磁体里有样品,样品就会升起并悬浮在室温腔管上口。

3. 取下老样品,把新样品放到气垫上。

4. 再次按下LIFT键。样品会缓慢落进磁体,精确进入探头中的位置。 5. 盖上室温腔管(非常重要,防止磁性金属微粒进入磁体)。

6.5 旋转样品 压缩空气的第二个作用是把样品旋转起来。之所以旋转样品,是因为可以“匀掉”一

些磁体中心处磁场的不均匀度。注意使用反向探头研究样品时一般是不旋转的。

以下是设置旋转频率的步骤:

1. 激活BSMS键盘上的SPIN RATE键。

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U6.6 调谐和匹配探头 2. 使用黑旋钮设置频率。 3. 激活SPIN键开始旋转。

旋转样品推荐值: 5mm探头 20Hz 10mm探头

12Hz

6.6 调谐和匹配探头

每个探头对不同频率信号的灵敏度是不同的,所以存在一个最灵敏的信号频率。而且,这个频率可以通过调整探头电路中的可调电容来改变。调谐就是指调整探头电路以获得对相应发射频率(SFO1、SFO2等)最大的灵敏度。探头中的每个线圈需要分别调谐。 如果更换了探头或者发射频率发生了明显改变,这时就需要重新调谐探头。日常工作中选择性探头使用有机溶剂时,发射频率的值不会有明显的改变。因此,一旦探头完成初始化调谐,频率的轻微改变不需要重新调谐。一般只有在发射频率变化超过100kHz时需要重新调谐探头。但是宽带探头,核与核之间的发射频率变化很大,因此每次替换选择原子核后都需要重新调谐。

每次调谐探头后还需要对其进行匹配。匹配就是使尽可能多的能量从探头基座传递到上部的线圈中。同时减少从探头基座反射回放大器的能量(等于浪费掉了)。所有的Bruker-BioSpin放大器都有50Ohms的输出阻抗,因此最优化的匹配是所有线路的探头阻抗也都是50Ohms。

通过观察下面任一种显示方式都可以进行调谐和匹配:

Topspin wobb 窗口(在命令行输入“wobb”打开窗口)中的wobble曲线 或者

HPPR封面显示器上的绿色和红色LED。

两种方法都会进行介绍,但是除非无法观察电脑显示器,第一种方法更加便利,这里首先进行介绍。

警告:下面讲到的调谐和匹配螺丝的可调范围是有限的,如果调出范围将会损坏探头。

6.6.1 使用wobble曲线进行调谐和匹配

Wobble程序通过把一个弱信号传输给探头,并把探头和线缆的阻抗与HPPR内的50Ohm参考阻抗进行比较。弱信号的频率的中心为SFO1、SFO2等,并在一定范围内“扫描”,范围通过参数WBSW定义(参见后面介绍)。合成的曲线类似于谐振电路的特性曲线,简单说,就是测量了不同频率(水平轴)下反射信号的振幅(竖直轴)。 匹配简单讲就是调整探头使wobble曲线的最小值处在显示的基线处(就是接触到水平的频率轴)。这表示了对传输信号的最小反射。调谐确保这个最小值出现在屏幕水平刻

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6 实验基本步骤 度的中心处。调节使需要使用仪器自带的特制工具旋动探头底部两个标有T、M的螺丝。这些螺丝使用探头前标签的颜色标示,探头的每组线圈都有的一对。匹配一般改变wobble曲线的竖直位置,而调谐改变曲线的水平位置。可以看出,调谐和匹配是互相关联的,必须串列进行。探头最合适的调谐和匹配就是wobble曲线的最小值居中且处于屏幕基线上。

图6.3 不同调谐和匹配情况下的wobble曲线图

Wobble可以使用“wobb”命令初始化,当调出wobble程序后需要修改两个参数: WBST(wobble步数,number of wobble steps): 默认值是1024,这个值不重要。

WBSW(wobble扫描宽度,单位MHz,wobble sweep width):

默认4MHz,调谐越好,这个值可以设的越小。如果你怀疑探头的调谐和匹配不好或者你无法观察到典型的谐振曲线,那么使用一个较大的WBSW值(例如32、MHz),当调谐和匹配合适后降到8或者4MHz。

步骤:

1. 确认SFO1的值接近最终发射频率。 2. 在Topspin命令行输入“wobb”。

3. 观察wobble曲线并据此调整调谐和匹配螺丝。

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U6.6 调谐和匹配探头 4. 当完成调整后,单击

或输入“stop”

如果需要,你可以把WBST设成1024,WBSW设成4MHz。可以通过wobb窗口的工具栏按钮完成(或者直接在命令行输入)。

6.6.2 使用HPPR LED进行调谐和匹配

这种方法只用在调节调谐和匹配螺丝时无法观察计算机显示器的情况下。唯一不同的地方就是需要根据HPPR封面显示模块上的红绿指示LED进行调整。

水平的一列LED表示调谐,竖直的一列LED表示匹配。调整的方向是尽量减少两个方向上发光的LED数目。和使用wobble曲线一样,调谐和匹配需要串列进行。对一个调谐匹配合适的探头,每个方向应该只有一到两个LED发光(注意一个LED表示最合适的调谐匹配)。 注意:使用这个方法时,需要打开wobb窗口,而不是打开采样窗口,来获得最大的刷新率。

步骤:

1. 确认wobb窗口已打开。

2. 设置参数,WBST为1024,WBSW为4MHz。 3. 输入“wobb”。

4. 观察HPPR上的LED,并据此进行调谐和匹配。 5. 当完成调整后,单击图6.4 HPPR/2的封面显示

或输入“stop”

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6 实验基本步骤

6.6.3 对多个核进行调谐和匹配

软件允许用户在不停止wobble程序的情况下改变原子核(也就是频率)。这在必须对多个核进行调谐和匹配的去耦实验中非常有效。显然,每个核都有一个不同的探头电路需要调谐。原子核和相应的频率需要使用“edasp”命令进行设置,这样wobble程序可以获取这些信息。

通过以下方法可以在Wobb时更改原子核和频率: 点击wobb窗口中工具栏上的或者,

如果在使用HPPR封面显示器,

如果是HPPR1,可以按CHANNEL SELECT 如果是HPPR2,可以使用显示器子菜单 两种情况下,都会以频率升序选定原子核。

按钮或者在Topspin命令行输入“wbchan”

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U6.7 锁定样品 6.7 锁定样品 锁场的所有参数都可以使用BSMS键盘手动调整,但是对于新用户,我们建议通过Topspin命令行输入“lock”调用lock程序来完成锁场。这将自动调整锁场参数来优化锁场。

就如在“锁场系统简介”一章中解释的,氘代溶剂被激发放射出信号,锁场系统检测并监视这个信号。这个信号的频率和强度取决于使用的溶剂。Topspin lock程序的主要特点就是可以把锁场能量,增益和频率设置到接近溶剂实际值。使用这些接近实际值的默认参数值,BSMS通过扫描一个频率或磁场强度范围,可以快速定位并“锁定”溶剂信号。通过“edlock”表设置这些这些溶剂相关的参数。

表6.1 默认edlock表

注意实际值需要管理员进行优化

BSMS可以使用两种方法搜索溶剂信号。在“场模式”下对样品周围的磁场(同时对氘的谐振频率)进行调整以保证对任何溶剂锁频率都为一常数。Edlock表中给出了根据溶剂不同调整相应场强的信息。这是操作的默认方式。

在“位移模式”中,锁频率改变自身以适应溶剂的改变,如果选择“位移模式”,需要在BSMS菜单中直接选择锁频率。

用户有三种方法可以用来锁场:

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6 实验基本步骤 1. 在Topspin命令行输入“lock”并选择相应的溶剂。首先磁场FIELD值会被设置成预先由系统管理员确定的值,这个值对所有溶剂是相同的。系统锁定后,会显示“lock:finished”。 2. 按BSMS键盘上的AUTOLOCK键。这不会要求选择溶剂,但是会改变FIELD值使探测到的锁信号位于扫场中心,同样达到锁场目的。 3. 按BSMS键盘上的LOCK-ON键。这不会改变FIELD值,只用在锁信号足够强且处于扫场范围之内时才能成功锁场。这种方法只推荐在替换相同溶剂的样品后使用,或者已经确认当前锁场参数是适合新溶剂。

6.7.1 锁场步骤

要查看锁信号可以点击工具栏上的样状态栏上的锁场区域。

在没有锁场前,屏幕上的信号表示两个重叠的氘连续波谱,一个从左向右扫描,另一个从右向左。扫描的速度可以通过调整BSMS键盘上的SWEEP RATE改变。高质量的CW谱图如图6.5所示。

图6.5 典型的锁信号

按钮或者输入“lockdisp”命令,还可以双击采

完成锁场后,信号应该是带有稍许噪音或波浪的水平线(参见图6.6)。这条线的高度被称为锁线高。

步骤:

1. 按下工具栏上的2. 输入“lock”。

3. 从菜单中选择相应的溶剂(这份手册描述的实验中选择CDCl3)。

按钮或输入“lockdisp”查看锁信号。

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U6.8 匀场 BSMS键盘上的autolock LED会开始闪动直到锁场完成。锁场成功后屏幕会显示信息“lock:finished”,LOCK On/Off LED开始发光。 4. 如果锁线高不稳定(信号饱和),这时就需要手动调整BSMS键盘上的Lock Power。(要避免这种情况反复发生,更好的方法是调整edlock表中的相应溶剂的lock power。事实上,需要咨询系统管理员检查并优化三个edlock参数LPower、LGain、LTime)

5. 如果需要,调整Lock Phase(锁相位)使锁线高最大。 图6.6 锁定样品后的锁显示

6.8 匀场 匀场是指对磁场进行一些小的调整来改善磁场的均匀性。改善磁场均匀性可以获得更好的谱图分辨率。在更换探头或样品后都需要重新匀场。保存每个探头合适的匀场值(保存在匀场文件中)可以极大降低更换探头后的匀场时间(参见“保存一组匀场值”一节)。 匀场由插到室温腔管内的室温匀场系统中的一组匀场线圈控制。线圈中的电流,同样还有磁体内的磁场,可以使用BSMS键盘进行调整。匀场线圈的数目取决于BSMS系统的类型。它们都有代数名称,如Z、Z2、X、Y等,相应的控制键可以在BSMS键盘的下半区找到。磁场是三维的,所以匀场项的名称使用XYZ坐标系统来反映相应的代数功能。 磁场均匀性的一个度量方法就是相同锁场能量和增益下屏幕上锁信号的高度(锁线高)。锁线越高,磁场越均匀。一种匀场的方法就是观察锁线高度的同时调整匀场电流直到锁线不能再升高。(注意:锁线高并不是对唯一可以用来匀场的磁场均匀性的度量标准,可

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6 实验基本步骤 以使用的还有线形和FID面积)。

下面讨论的可以分辨的两类匀场。

6.8.1 初始匀场

在磁体升场完成后,必须由安装工程师从混乱中进行初始匀场。每个匀场线圈的电流的大小都是需要优化。这个过程之所以复杂,是因为匀场项都是互相关联的,调整一个后必须调整另外几个,磁体必须针对每个探头进行匀场。特定探头的匀场值可以储存到一个匀场文件中已备在更换探头后重新调入。咨询系统管理员了解每个探头应该使用哪个匀场文件。

6.8.2 常规匀场

一旦完成初始匀场,操作就简单了。只需要调整最重要的几项,使样品所处的一段磁场最均匀即可。这就使常规匀场,应该在每个NMR进程最开始和每次更换样品后进行。常规匀场就是微调Z和Z2项(可能还有X和Y)。过程大体如下: 1. 如果更换了探头需要首先把正确的匀场文件读入BSMS单元。这一组匀场值应该适合这个探头。输入“rsh”会出现一个所有的匀场文件的列表。双击相应的文件,等待几秒钟,就会出现以下信息: rsh:finished。

2. 确认BSMS键盘上的LOCK键已经激活。也就是样品已经被锁定。如果要旋转样品,把旋转速度设为20Hz(5mm探头)或12Hz(10mm探头)。

3.

调整LOCK PHASE使锁线最高。

4. 调整LOCK POWER,如果需要,设定一个低于饱和值6dB的值。饱和值是指锁线高度开始变得不稳定,开始上下摇摆时的LOCK POWER值。

5.

激活BSMS键盘的Z键(“on-axis”+”Z1”)。转动旋钮使锁线达到最高。

6. 激活BSMS键盘的Z2键。转动旋钮使锁线达到最高。(可能需要调低LOCK

GAIN使信号保持在屏幕上)。

7. 8. 9.

重复第五、六步直到锁线不能再升高。 最后调整LOCK PHASE使锁线达到最高。

关掉样品自旋,调整X和Y匀场项(“”/“”+“”)使锁线达到最高。

注意:经过一段时间后,磁体内外的情况可能有轻微的改变,可能需要调整高阶项Z3,Z4和Z5来优化性能。另外,对于使用H2O/D2O作溶剂的样品实验需要更多的匀场以改善水峰压制的效果。

锁线高度并不是磁场均匀性变化的最好标准。虽然不在本手册讨论范围之内,但是事实上,信号的线形(宽度和对称性)才是磁场均匀性最好的反映。等到有了更多的经验后,你就可以和系统管理员讨论如何利用信号线形优化高阶项的问题。

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U6.8 匀场 请注意有一个名称为“gradshim”(gradient shimming,梯度匀场)的程序可以使用氢和氘信号自动匀场。如果这个选项可用,你应该咨询系统管理员进行了解,这将大大简化匀场过程。

关于匀场更详细的资料参见BASH CD上BSMS用户手册第六章。

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7准备采样——数据集,

edasp、eda命令

7.1 简介 这一章节将解释最重要的两组参数,通过“eda”和“edasp”命令可以分别调出。虽然类似于“edasp”还有第三个命令“edsp”,这里只介绍“edasp”,因为它更有用。在给不同参数指定值之前,重点要理解数据集的内容,以及参数组是关联不可分的。

7.2 数据集 随着谱仪的使用数据的量会急剧增加。用户会希望把数据储存在规则命名的文件中以便于日后访问。这在多用户环境中尤显重要。在采集一组数据后,可以把它储存成一个数据集。每个数据集必须拥有一个唯一的主字码(即识别码)来进行区分。一个完整的数据集主字码需要使用五个参数:DIR、USER、NAME、EXPNO和PROCNO。下面介绍这些参数。

1、DIR(顶层目录):在拥有巨量数据的系统里,DIR定义了所有用户可以在其中创建自己数据目录的目录。

2、USER:由于多个用户访问一台谱仪,因此用户的登入ID应该成为数据集主字码的一部分。每个数据集必须包含USER。此外,只用属于同一个组的用户才可以改动和删除该组的数据集

3、NAME:即使只有一个用户采集数据,也需要分析不同的样品。为了区分不同的样品,在数据集主字码中使用了参数NAME。用户可以自由选择任何NAME,但是一般应该使用一个和样品相关的。例如,短杆菌肽(gramicidin)的数据集可以使用“gram”作为NAME,cholesterylacetate的数据集可以使用“cholac”。 在解释另外两个数据集参数之前,我们先来区别原始数据(raw data)和处理数据(processed data)。 在把样品放入磁体并采样后,这时采集的数据集被称为原始数据集。也就是1D实验的FID或者是2D实验的一系列FID。之所以称之为“原始”数据是因为还没有经过处理。

通过傅立叶变换把这些FID从时域信号转变成频域信号,通常还会乘上窗函数并进行相位矫正。最终得到的数据被称为处理数据集。

一组原始数据会被使用不同的方式进行处理,数据集主字码必须考虑这点。我们使用两个参数来进行区分:EXPNO和PROCNO。不同于参数USER和NAME,参

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7准备采样——数据集, edasp、eda命令 数EXPNO和PROCNO只能使用数字值。

4、EXPNO(实验号):每个不同的原始数据都被赋予一个唯一的EXPNO。例如,我们会使用不同的采样参数对同一个化学样品进行多次分析。每个原始数据集都被赋予了一个唯一的EXPNO来进行区别。

5、PROCNO(处理号):PROCNO用来区分相同原始数据下不同的处理数据集。 数据集参数的正确使用方法可能最好通过示例来讲解。但是由于在NMR实验进程中参数USER或DU不会改变,这里就不涉及这些参数。

示例:

假设现在有两个短杆菌肽(gramicidin)样品需要分析。我们可以分别使用NAME“grama”和“gramb”来创建两个数据集。你可能决定在不同的情况下采集FID并进行分析,例如你可能希望在三个不同的温度下Tx、Ty、Tz对每个样品进行分析。据此,你可以通过给每个实验赋予唯一的EXPNO来进行区别。

这样产生的六个原始数据组,在下表列出: 表 7.1 不同EXPNO和PROCNO的数据集

NAME EXPNO PROCNO Grama 1 Tx Grama 2 Ty Grama 3 Tz Gramb 1 Tx Gramb 2 Ty Gramb 3 Tz 这种情况下每个原始数据集都可以通过参数NAME和EXPNO进行唯一标示。 用户现在可能决定使用两种不同的方法处理原始数据集,例如,使用和不使用指

数乘运算。要想区分两种处理方法和相应的频谱,就要使用PROCNO参数了。由于每个原始数据集分别被处理的了两次,因此使用两个PROCNO。现在应该有十二个处理数据集,如下表所示。

表 7.2 不同NAME、EXPNO和PROCNO的数据集 NAME EXPNO PROCNO Grama 1 Grama 1 Grama 2 Grama 2 COMMENT

温度Tx,不使用指数预算 1 温度Tx,使用指数预算 2 温度Ty,不使用指数预算 1 温度Ty,使用指数预算 2

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U7.3 创建数据集 Grama 3 Grama 3 Gramb 1 Gramb 1 Gramb 2 Gramb 2 Gramb 3 Gramb 3 温度Tz,不使用指数预算 1 温度Tz,使用指数预算 2 温度Tx,不使用指数预算 1 温度Tx,使用指数预算 2 温度Ty,不使用指数预算 1 温度Ty,使用指数预算 2 温度Tz,不使用指数预算 1 温度Tz,使用指数预算 2 注意:在使用NAME、EXPNO和PROCNO时不允许两个数据集使用相同的主

字码,也就是说,它们必须全部被唯一定义。

7.3 创建数据集 谱仪采集的所有数据都自动储存在被称为“当前”数据集中。当前数据集的细节可以在Topspin数据窗口的标题栏找到。

在你采集新数据前,应该首先创建一个新的数据集来储存数据。这可以避免覆盖已有数据。

“创建数据集”这个说法可能会造成误解。到这一步你并没有采集任何数据,创建数据集只是命令计算机准备了一组用于储存数据的文件。

要创建一个新的数据集,你可以点击File->New,或者按下Ctrl-N,或者点击上部工具栏上的

按钮,或者在命令行输入“new”(命令“edc” 也可以)。这样会出

现如当前数据集的详细信息,图 7.1 所示的当前数据集是:

C:\\Bruker\\TOPSPIN\\guest\\hydrogen\\1\\1

你现在可以创建自己的数据集了。NAME可以是最多13个字符的字符串。EXPNO

和PROCNO都输入“1”。选择你样品的溶剂以及打算运行的实验。注意,这时你新建的数据集成为当前数据集,主字码参数的细节将出现在Topspin的数据窗口标题栏。 最后要提醒注意的是赋予新数据集的参数值。示例中,如果不选择实验,C:\\Bruker\\TOPSPIN\\guest\\1\\1中的参数,例如采样参数,会被带至新数据集。这些值是可以改变的。

图 7.1 edc窗口

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7准备采样——数据集, edasp、eda命令

7.4 谱仪参数edasp 命令“edasp”是编辑采样谱仪参数(edit acquisition spectrometer parameters)的简写。这些谱仪参数负责针对特定的实验来配置谱仪。例如,在设定它们后,它们会准备类似于路由器的设备把正确的信号传送给相应的功率放大器。“edasp”命令允许用户根据需要研究的原子核来设计实验,也就是选择相应的功放,功放输出和HPPR模块。

准备实验的第一步就是使用“rpar”命令来读取一组参数,并编辑“edasp”窗口。在使用“eda”命令设置采样参数之前一定要确认正确设置了谱仪参数。用户需要注意:

1、对谱仪参数集的任何调整(经由“edasp”窗口)都会影响到采样参数集(“eda”表)。 2、对采样参数集的任何改变(例如改变频率偏移)只有在随后输入“edasp”(不是“edsp”)的情况下才会影响到谱仪参数集。这样在“eda”表中做的改动才被保存。 3、如果在改变采样参数后,输入的是“edsp”(而不是“edasp”),那么,所有的改动都会丢失,恢复到前一组谱仪参数。

用户应该注意,在读入一组标准参数时,采样参数和谱仪参数都已经被设置。 就像刚才提到的,命令“edasp”比“edsp”更有用,推荐用户熟悉它的使用。 如果硬件(FCU、路由器、SGU等)已经正确连接及配置,用户可以设定他们想要的任意实验,只要它在edasp窗口中可用。软件会负责FCU和功放之间的硬件连线,以及路由器或功放内部任何必须的切换(参见图 7.2)。例如,如果质子被选定为观察核(1通道),FCU2会被选择为默认,这与硬连线一致。注意,无论如何,软件不能控制任何跟定功放输出和HPPR之间的连接。虽然到HPPR的连接显示在edasp窗口,但对HPPR连接的改变并不能物理上影响到硬件。用户必须确认当前的连线是

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U7.4 谱仪参数edasp 合适的。(注意:之所以显示HPPR模块是为了让软件可以到探测F1通道的最终连接点,这个模块会被选定为OBS模块)

用户可以安心使用“edasp”窗口。在“edasp”窗口中所作的改动绝对不会影响到硬件,直至输入“ii”(initialize interfaces初始化界面)命令。甚至在完成界面初始化后,实际的脉冲输出也没有开始,直至输入 “zg”、“gs”或者“go”等命令。 如果你改变了谱仪参数,你可以很容易地通过读入标准参数集来恢复标准设置。例如:

输入“rpar PROTON”(点击copy,选择acqu) 来重置观察1H的谱仪参数

输入“rpar C13CPD” (点击copy,选择acqu) 来重置带CPD去耦观察13C的谱仪参数

7.4.1 edasp窗口布局

带SGU的AVANCE谱仪的软件设计根据谱仪配置自动定义edasp窗口。这样,用户只看到自己谱仪上实际有的硬件。edasp窗口由几个竖直列组成,具体如下。

1、频率

各个通道发射信号的频率,由SFO1、SFO2、SFO3等参数分别设定。但是这些频率无法直接设定(你会发现无法使用鼠标把它们标成高亮)。

发射频率通过设定相对于基本频率BF1、BF2、BF3的偏移来控制。 对于观察通道:

SFO1 = BF + 偏移 发射频率 自动设定 用户设定 类似的,两个去耦通道 SFO2=BF2+偏移 SFO3=BF3+偏移

偏移量的标示为OFSH1、OFSX1、OFSF1等,命名的规则参考“edasp窗口的一些特性”一节。注意这些参数不能在命令行改正。

在选定一个特定核之后,对应的基本频率会被自动设定。在读取标准参数集后,基本频率参数会正确设定,只需要调整偏移量。

记住SFOX是最重要的参数,因为它确定了实际发射到样品上的频率。注意偏移可以设成零,这样SFOX=BFX更详细的描述在“发射、基本和偏移频率的数字解释”一节给出。

2、逻辑通道

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7准备采样——数据集, edasp、eda命令 这一列可以选定要研究的原子核。逻辑通道F1或者NUC1总是观察核。如果一个通道没有被使用,应该关闭它。可用的原子核列表是保存在

TopspinHome/conf/instr//nuclei 经验丰富的用户可能希望编辑这个文件来定义可用的核。

注意如果改变逻辑通道的原子核类型,直接的影响就是频率列的基础频率会被自动调整。

3、FCU

系统会自动设定到相应FCU的连接,建议初级用户不要替换默认的连接方式。 图 7.2 “edasp”菜单(读入“PROTON”标准参数集后)

4、功放

系统会自动设定到相应功放的连接。功放的输出很容易辨认,它们处在功放的右手边,标有“X”“19F”和“1H”等。根据安装的功放类型不同,edasp显示是不一样的。

使用内置功放的系统:

如果是BLA2BB,1H的输出连接到1H HPPR,X输出连接到X-BB HPPR模块。这两个连接很清晰,不可能弄错。如果系统还有一个内置的BLAX300,那么就会有两个X功放。你只需要确认,无论观察通道使用哪个X功放,用线把这个功放的输出连

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U7.5 基本采样参数:“eda”表 到HPPR X-BB模块。

使用外置功放的系统:

有多种可能的功放配置,其中一些功放可能有三个标有“X”“19F”“1H”。无论

哪种配置,基本规则是一样的。在edasp窗口选定一个功放后,确认该功放的输出物理上连接到相应的HPPR模块,或者直接连接到探头。

5、前放

根据不同系统,最多可能有5个HPPR模块。在多数系统中,功放输出和HPPR模块之间是一对一的对应。无论哪个功放输出,如果是负责发射观察脉冲,它必须通过HPPR模块连接。去耦通道通常也是通过HPPR模块连接的,虽然它们也可以直接连到探头。

7.4.2 edasp窗口的一些特性

在使用edasp窗口时,应该注意以下几点:

1、逻辑通道F1总是作为观察通道,其它所有通道(F2,F3等)都是去耦通道。 2、软件考虑了各种标准硬件配置。例如,如果观察质子,默认使用FCU2。这是因为路由器的输出2(没有在edasp面板显示)连接到了氢功放的输入。

3、对于原子核的分组,依照以下规则:

H=氢原子核,即1H

F=3H、19F X=其它所有原子核

7.5 基本采样参数:“eda”表 这个参数集和谱仪参数一样,可以通过点击数据窗口的“AqcuPars”标签调出,

或者使用“eda”命令(edit acquisition parameters)。这个参数集在关于采样最重要的参数。下面的章节将简要介绍这些最重要的参数。新用户必须熟悉这些参数。关于这些和其它参数的更多细节,可以在《Topspin采样参考手册》或者《Topspin处理参考手册》中找到。本文提供了应用需要的足够细节。如果用户关心的是尽快做出一张谱图,可以直接跳到“氢谱”一章,使用名为“PROTON”的标准参数集。系统将自动设定合适的采样参数。这样做的缺点就是,由于不需要理解基本流程,用户不可能有足够知识对参数进行相应优化。

这里列出的参数是按照eda表中的顺序给出。

PULPROG:采样使用的脉冲程序(pulse program)。它将在“zg”、“rga”、“gs”、“go”命令后运行。

图 7.3 eda参数的第一页

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7准备采样——数据集, edasp、eda命令 (读入“PROTON”标准参数集后)注意只有粉红色高亮显示和出现“Edit” 的区域才允许用户进行调整。

Experiment

NMR实验需要使用一个精确定义的脉冲序列来激发样品。这个序列通过脉冲程序定义,一般是一组由延迟间隔的脉冲。每个程序都有一个唯一的名字以进行区别。名称作为PULPROG参数输入。这本手册中提到的“zg30”程序经常出现在需要数据累加的1D NMR实验中。

AQ_mod:采样方式(Acquisition Mode)

确定两个接受通道如何共享数据。对于基于SGU的AVANCE系统请选择DQD。 TD:时域数据长度(Time Domain Data Size)

在处理NMR样品放射出的信号之前,需要先把信号数字化。TD的值就是从FID中采样和数字化的点数。对于1D FID,TD一般为16、32或者K。虽然增大TD会改善FID分辨率,同时也会需要更长的采样时间。

NS:扫描次数(Number of Scans)

在NMR实验中,经常需要多次累加(扫描)来改善谱图质量。(实验的时间当然

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U7.5 基本采样参数:“eda”表 也会相应增加)。采样的次数由参数NS指定。NS通常是8的整数倍,即脉冲程序内

标准相位循环次数的倍数。

DS:空扫次数(Number of Dummy Scans)

采样程序中某些脉冲负责在正式采样前首先激发样品。也就是先让样品进入一个稳定或者说均衡的状态。由于并没有采集数据,这些脉冲序列被称为“空扫”(dummy scans)。空扫的次数取决于样品的驰豫时间以及对加热的敏感度,通过NS设定。标准实验的典型值是4或8。

PARMODE:参数集类型(Parameter Set Mode)

根据实验的类型可以设定为1D,2D或3D。本手册描述的实验都是1D。 Width

SW:谱宽(Spectral Width)

有时也代表扫描宽度(sweep width),这是对谱图所分析的频率宽度的度量。样品放射出的一般是一个频率段而不是一个单一的频率。

频率在谱宽范围内的信号才可以被探测到,此外的信号都被过滤掉了。如果你很了解自己样品的谐振频率,你可以设定一个比较小的SW(这样做有很大优点)。另一方面,在分析未知样品时,首先使用一个比较大的SW。可以认为SW,单位ppm,是一个谱图观察窗口的宽度。对于氢谱,20ppm的SW足够捕捉到所有的信号,当然SW的中心SFO1,激发频率,也要正确才可以。这本手册中多次提到的“PROTON”标准参数集中使用的SW为20.6ppm。

在调整SW时一个有用的功能是utilities下的SW-SFO1功能。这会自动把屏幕上显示的区域宽度定义为SW,把区域的中心定义为SFO1。

SWH:赫兹为单位的谱宽Spectral Width in Hertz

和SW意义相同,不过以赫兹为单位(参考“标样,赫兹,ppm”一节)。改变SW的值会自动改变SWH的值,反之亦然。当赋予SW或SWH任意值后,软件会自动调整这个值来保证模数转换器的dwell时间为一离散值。SWH的最大值取决于模数转换器的类型。

AQ:采样时间Acquisition Time

采样时间是完成一次扫描所需要的时间(单位:秒)。它是根据TD和SW的计算出的。当然,也可以直接修改AQ值, 这时TD的值会相应改变。

图 7.4 部分采样参数的图示

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7准备采样——数据集, edasp、eda命令

FIDRES:赫兹为单位的FID分辨率FID Resolution in Hertz

这是根据SWH和TD的值自动计算出的值。即SWH/TD的值。出现在屏幕上的谱图实际上是一系列用直线连接起来的点。每个点代表一个被称为FID分辨率的频率范围。FIDRES的值越小,谱图越精细。

FW:滤波宽度Filter Width

原来的逻辑滤波器根据SW和SWH的值自动设定来过滤掉谱宽之外的接收信号。由于现在采用了数字滤波器,只需要粗略的逻辑滤波器。根据模数转换器,你可能在eda表中看到有限的几个取值,诸如20KHz,90KHz,125KHz,625KHz等。

Receiver

RG:接收机增益Receiver Gain

接收机增益是关系到FID振幅和模数转换器动态范围相适应的参数,通过观察FID来获得合适的增益。如果FID在屏幕最顶部或最低部被“剪掉”,那么应该降低增益。另一方面,如果增益太低FID没有合适利用模数转换器的量程(25-50%),那么应该增大增益。在观察FID幅度时,确认竖直方向的缩放为默认值。增益还可以使用“rga”命令自动设定,建议新用户使用这个命令。

图 7.5 RG太大造成FID被“剪掉”

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U7.5 基本采样参数:“eda”表

DW:驻留时间Dwell Time

数字滤波和过采样技术的出现,降低了这个参数的意义。这个参数表示对FID进

行模数转换时,满足Nyquist法则的两个采样点之间的理想时间,单位为毫秒。这个参数是自动根据方程DW=106/2*SWH计算得出的。

DWOV:过采样驻留时间Oversampling Dwell Time

这是使用数字滤波和过采样技术的模数转换器真正使用的DW时间,当DIGMOD(见下)参数的值为“digital”或“homodecoupling-digital”时有效。DWOV的值是自动计算的。

DECIMATION:数字滤波的采样抽取率Decimation Rate of Digital Filter 这是DW和DWOV的比值表示FID被过采样的因子。这个参数是使用方程DECIMATION=DW/DWOV自动计算设定的。

DSPFIRM:数字信号处理固件Digital Signal Processing Firmware 设置为“sharp(standard)”

DIGTYP:模数转换器类型Type of Digitizer

谱仪中使用到的模数转换器的类型有SADC、HADC+、FADC等。这个参数使系统和多个转换器类型兼容。但在eda表中,只有谱仪实际有的类型可选。如果你在expinstall过程中选择了DIGTYP,那么在每次读入标准参数时这个参数都会自动设定好。

DIGMOD:模数转化器工作模式Digitizer Mode

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7准备采样——数据集, edasp、eda命令 对于基于SGU的AVANCE系统应该选择“digital”模式。如果要做同核去耦的实验,应该使用“homodecoupling-digital”模式。如果选择“analog”模式,不会使用到数字滤波功能。

DE:扫描前延迟Prescan Delay

DE是在开始采集数据前的延迟时间。这个延迟,自动以微秒设定,确保激发脉冲在采样开始前完全消逝。在“expinstall”过程时,会让用户输入一个DE值。在读入标准参数集“PROTON”时,这个值会自动设置为6微秒,这个时间适用于这本手册中所有的实验。

Duration

P(us):脉宽Pulse P0 - P63

脉冲程序可以使用的脉冲宽度共一组个。默认单位是微秒(使用“u”代替“μ”)。输入“m”或“s”可以把单位换成毫秒或秒。标准的90度脉冲的脉宽总是“P1”。虽然“eda”表中显示的脉宽参数是大写,但在编写脉冲程序和通过Topspin命令行直接调用时,必须使用小写字母。

在设定脉宽时,用户必须注意如果脉冲太长会造成探头过热,甚至形成电弧,特别是在脉冲能量没有足够衰减的情况下。典型的观察脉冲(相对于去耦脉冲)的长度为6-15μs。

D(s)*:延迟Delay D0-D63

点击“eda”表上的这个参数可以调出一组共个延迟时间, D0 - D63。其中的每一个都可以设定,并在脉冲程序中引用。注意如果不指定时间单位,默认单位是秒。当然,可以使用“u”代表微秒,使用“m”表示毫秒。“D1”是弛豫延迟时间。相对于通过延迟表改变延迟,直接通过命令行调出需要的延迟更方便。虽然“eda”表中显示的延迟参数是大写,但在编写脉冲程序和通过Topspin命令行直接调用时,必须使用小写字母。

Power

PL(dB):脉冲能量级别Power Level in dB

点击这里可以调出一组共个脉冲能量,PL0 - PL63。其中的每一个都可以设定,并在脉冲程序中引用。PL的值越大,衰减越大,信号也就越弱。脉冲能量还直接和所使用的功放类型有关,同样的PL值在不同类型的功放上对应的能量大小差别会很大。

在一段脉冲程序中,八个通道可以使用任意一个PL值,如果没有明确指定,PLx即对应Fx通道。在这本手册中,主要用到的是“pl1”,它确定了F1(观察)通道的衰减。

和所有的参数组一样,直接从Topspin调用参数比通过“eda”表输入更方便常用。再次强调,虽然“eda”表中显示的PL参数是大写,但在编写脉冲程序和通过Topspin命令行直接调用时,必须使用小写字母。

由于历史原因,任意一个通道的最大能量(最小衰减)都是-6dB。这样设计是为

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U7.5 基本采样参数:“eda”表 了减小用户在使用不同谱仪时的差异感。注意降低能量级别,实际上是增大了激发脉

冲的衰减量(以dB计)

图 7.6 能量与衰减的关系

用户应该明白,把探头搞坏的最简单的办法就是使用最高的能量级别。因此标准参数集的默认级别总是120dB,最大衰减,零能量。用户应该向系统管理员了解不同探头恰当的能量级别,或者使用“getprosol”命令。关于“getprosol”命令参见“‘getprosol’表”。

Nucleus 1

NUC1:观察核的名称Name of Observe Nucleus

需要观察的原子核的名称。观察核一般通过edasp菜单设置来改变eda中的显示。观察核出现在eda菜单中是为了提示用户。

O1:以赫兹为单位的F1通道发射机频率偏移Transmitter Frequency Offset for Channel F1 in Hz

SFO1:发射机频率Transmitter Frequency

这个频率用来激发被观察的原子核(逻辑通道F1),也是谱图的中心频率。也可以理解成谱图观察窗口的中心频率。

O1P:以ppm为单位的F1通道发射机频率偏移Transmitter Frequency Offset for Channel F1 in ppm

BF1:以赫兹为单位的F1通道发射机基础频率Basic Transmitter Frequency for Channel F1 in Hertz

系统会根据要观察的原子核(例如13C、1H)自动设定这个频率。

下面将解释如何正确使用SFO1、BF1和O1三个参数。读者应该明白一般在NMR谱上水平轴是频率轴,而且是向左增大。

三个参数的关系可以表示为: SFO1 = BF1 + O1

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7准备采样——数据集, edasp、eda命令 如果存在多个逻辑通道,最多8个,相应地,通道X中选定的核称为NUCX,且: SFOX = BFX + OX

用户必须理解这些参数之间的关联,在7.5.1节中会结合实例进行讨论。 Lock

LOCNUC:锁场核的名称Name of Lock Nucleus

,有些时候,主要是在当氘信号干扰到真正的样品信号时,一般这里是2H(氘)

。19F锁需要特殊的硬件。 会是19F(氟)

7.5.1 发射、基础和偏移频率的数学解释

假设使用600M的谱仪来观察氢。谱仪的BF1为600.13MHz。(500M谱仪的BF1

为500.13MHz,400M谱仪的BF1为400.13,以此类推)

如果O1被设定为零,那么: SFO1 = 600.13 + 0 =600.13 MHz

于是谱图的中心将处在600.13MHz处。如果SWH为20kHz,假设谱图如下图示。

图 7.7 BF1=600.13MHz,O1=0Hz时的谱图

从我们假设的谱上,我们可以清楚地看到NMR信号出现在谱图的高频段。因此一些信号可能处在600.14MHz以上,由于这些信号处在谱图窗口以外,都被过滤掉了,所以我们观察不到。有两个方法可以确认这些信号是否存在:

a)

增大谱宽,把丢失的信号包含进来。但是这样和增加FID分辨率存在同样的缺点(FIDRES值越小,分辨率越好)。 更好的方法是保持谱宽不变,赋给O1一个值来移动窗口的中心位置。

b)

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U7.5 基本采样参数:“eda”表 在我们的例子中,被探测的信号全部处在600.138MHz附近区域,我们想要把谱

图的中心调整到这个频率。

Ö SFO1 = 600.138 = BF1 + O1 Ö 600.138 = 600.13 + O1 Ö O1 = 0.008MHz = 8 kHz

因此,如果O1,偏移频率,设置为8kHz,谱图窗口的移动如图7.8所示 图 7.8 BF1=600.13MHz,O1=8 kHz时的谱图

最终,我们在图中清楚地看到我们所假设的样品中的氢放射出的NMR信号只占据了谱宽的一小部分。这时我们可以减小谱宽,而不用担心丢失信号。减小谱宽的一个好处是可以提高谱图的分辨率。(一个坏处是采样所需要的时间会相应延长。) 在第3章中我们提到,质子的化学位移极少超出14ppm。在600MHz的谱仪上即是8.4kHz。图7.9中给出了把SWH从20kHz改为8kHz后重新采到的谱图。

图7.9 BF1=600.13MHz,O1=8 kHz,SWH = 8.4kHz时的谱图

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7准备采样——数据集, edasp、eda命令 需要注意的是,每一个实验使用的SWH值取决于所分析的样品和需要的谱图分辨率。对于氢谱,14ppm可以确保采集到绝大多数质子信号。如果需要对特定信号进行更详细的研究,就需要更小的SWH。

下图说明了SFO1、BF1和O1相互作用的基本规则(这里使用的是另一只样品)。 图 7.10 SFO1、BF1和O1的相互关系

utilities子菜单下的SW-SFO1功能可以协助设置合适的谱宽(扫描范围)。更多细节参见“使用SW-SFO1功能调整谱宽”。

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8 脉冲程序 / ased命令

8.1 脉冲程序“zg”和“zg30”

就如在介绍采样参数的一节提到的(参见“基本采样参数:‘eda’表”),脉冲程序是

用来定义激发样品的脉冲序列。新的带SGU的AVANCE谱仪都会附带一组标准脉冲程序。输入“edpul”可以查看脉冲程序列表。滚动列表找到“zg30”程序。点击“zg30”,就可以阅读程序,如图8.1。

关于脉冲程序的详细描述不在本手册涵盖范围之内,但是关于“zg30“的一些注释可以帮助用户理解哪个参数是重要的,以及为什么是重要的。标准的一维实验会使用90度脉冲来激发NMR样品来获取最强的发射信号。无论如何,这也需要增大激发脉冲之间的间隔时间使样品充分弛豫。这样如果需要重复激发样品,更有效的方法是使用30度脉冲激发,减少相应的弛豫时间。虽然每个放射信号比较弱,但更快的数据累加速度使30度脉冲拥有在整体上更好的灵敏度。“zg”是90度激发标准脉冲程序,“zg30”是30度激发标准脉冲程序。

关于Bruker脉冲程序中使用的一系列能量水平、脉冲、延迟和循环计数器的约定叫法,参见文本文件$TopspinHone/exp/stan/nmr/lists/pp/Param.info。关于Bruker脉冲程序命名的约定规则可以参考$TopspinHome/exp/stan/nmr/lists/pp/Pulprog.info。最后,关于最新的软件改动的说明文件是$TopspinHome/exp/stan/nmr/lists/pp/update.info。

$TopspinHome代表Topspin程序的安装目录(Windows下是C:\\Bruker\\Topspin,Linux下是/opt/Topspin)。

8.2 “zg30”程序详解

脉冲程序中以分号打头的各行是为帮助用户阅读而作的简单注释。程序编译器将忽略这些以分号打头的行。出于同样的原因,“zg30”程序的每一行都被赋予了一个号码,无论脉冲程序何时被显示,这些行号都不会出现在Topspin窗口内。

前四行是示例注释。第1行只是给出了脉冲程序的标题,第2行是版本号,第3行提示这个程序适合一维NMR实验,第4行提醒用户这个程序设计是使用30度脉冲而不是90度脉冲(因此这个程序叫zg30)

图8.1 脉冲程序“zg30”

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8 脉冲程序 / ased命令

第5行不是注释,而是把定义在一个文件中的标准脉冲编程文本包含进来。 第6行:1 ze——这没有分号打头的一行,才是实际的第一行程序。程序中的所有行都可以编号以便于形成循环,这一行自然被编成第1行。命令“ze”(zero)会把当前内存中所有的数据用第一次采集的数据覆盖,后续采集的数据会被叠加到内存里。“ze”命令实际上就是为实验中即将采集的数据清除,或者清零内存。

第7行:2 d1——这一行是延迟命令。这个延迟被称为“d1”。延迟就是暂停不发射任何脉冲。d1的长度可以在“eda”菜单的delay表中指定。

第8行:p1*0.33 ph1——命令p1*0.33命令谱仪发射一个长度为p1乘以0.33长度的脉冲。也就是30度激发脉冲,如果是p1长度就是90度脉冲。任何脉冲信号都有三个特征参数:1)长度,2)振幅,3)相位。

长度或者说脉冲持续时间可以在eda菜单pulse表的p1值设定。

脉冲的振幅取决于它的能量水平。在这个例子中,没有提到能量设定,所以谱仪会使用pl1作为默认值。pl1的值可以在eda菜单的power level表中设定。

还应该提到的是,如果脉冲程序没有指定通道,脉冲将直接被送进观察通道(也就是通道1)。第8行同时也指定了脉冲的相位为“ph1”。 第9行:go=2 ph31——这个命令会启动一系列进程,包括打开接受机并数字化NMR信号。在采样完成后,也就是TD个点被数字化后,程序会循环回以2开头的第7行。整

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U8.3 命令“ased” 个进程重复NS次(假设DS=0)。如果NS=8,那么第7、8、9行汇循环执行8次。第9行同时使用命令ph31设定了接收机相位。

现在第7行“d1”延迟的必要性更加体现出来了。使用一系列的脉冲和不足的弛豫时间激发NMR样品会造成样品饱和。或者说它吸收了多于它能释放的能量。为了给样品时间释放出更多的能量,每个脉冲前都添加了“d1”延迟。这样可以给样品足够的时间来弛豫。 第10行:wr #0——这个命令电脑把采集的数据保存到硬盘上。数据会被保存在以参数NAME、PROCNO、EXPNO等参数定义的当前数据集中。

第11行:Exit——这个命令告诉电脑已经到了脉冲程序的结尾。

第12、13行:这两行定义了发射机(ph1)和接收机(ph31)的相位循环序列。 以上的描述应该让读者注意到,在运行“zg30”以前,有几个参数必须首先设置,就是“d1”、“p1”和“pl1”。注意脉冲程序的最后三行向用户解释了这三个参数的含义。“p1”、“d1”、“pl1”的确切值取决于需要分析的样品和所使用的探头。 除了发射的是90度脉冲,而不是30度脉冲,常用的脉冲程序“zg”和“zg30”是完全相同的。

图 8.2是脉冲程序“zg”的图示,NS=4,DS=0。

到目前为止,读者对采样的要素有了基本的了解。这本手册的剩余部分将专注于怎样一步步采集谱图。

图 8.2 NS=4、DS=0的脉冲程序“zg”

8.3 命令“ased”

现在,你已经熟悉了采样软件和一些基本的脉冲程序,可以学习一个更深入的命令“ased”。这个命令可以用来设置特定脉冲程序的采样参数,例如,脉冲、延迟。

这个命令参照于当前的脉冲程序,也就是在“eda”表中PULPROG输入的程序。确认zg30是当前脉冲程序,选择数据窗口中的“AcquPars”标签,点击工具栏上的钮或者是“AcquPars”表中Pulse一行的问号,或者输入“ased”。

显示会变成一个类似“eda”的表格。注意,“eda”表中有完整的延迟和脉冲阵列,而“ased”只是有“p1”和“d1”。这是因为“zg30”没有用到其它的脉冲或者延迟。现在可以根据实验来修改“ased”表中的参数。所有的改变都会反映到“eda”表。点击SAVE返回“AcquPars”表。因此,“ased”是一个只关心当前实验中有意义的参数的命令。

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8 脉冲程序 / ased命令 最后不要忘了,所有的参数都可以直接在Topspin命令行中调整。这在实验需要“微调”时尤其有用。

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003中文版

9 氢谱

9.1 前言 这一章将讲述氢谱的做法。使用的样品是溶在氘代氯仿(添加0.5%TMS)中的100mg Cholesterylacetat。主要步骤是:

1、 放入样品,可以把样品转起来; 2、 锁场(参见“锁定样品”一节); 3、 如果需要,进行探头调谐; 4、 匀场,Z和Z2项;

5、 建立新的数据集,例如 hydrogen 1 1; 6、 读入一个标准参数集,例如PROTON; 7、 使用“getprosol”命令读取“prosol”文件; 8、 使用“rg”或“rga”设定接收机增益; 9、 如果是想先采一次样,那么把NS从16改成1; 10、

点击Topspin工具栏上的

按钮,或者输入“zg”进行采样

11、 选择Processing菜单下的Fourier Transformation,在弹出的窗口中选择标

准傅立叶变换,点击OK。选择Processing菜单下的Phase Correction,在弹出的窗口中选择自动相位校正,点击OK。当然,你也可以输入“ft”和“pk”命令来变换谱图并执行自动相位角校正。 后面还会提到诸如手动相位校正和手动校准的处理技术。

步骤1、2、3、4已经在前面的章节中作过介绍,我们的讲解从步骤5开始。

9.2 创建新数据集 在设置相应的采样参数以前,我们建议你创建一个新的数据集。下面将建立一个特定名称的数据集,当然你可以选取你喜欢的名称。建议用户在想调整任何采样参数前首先建立一个新数据集,这样可以通过对两个数据集的比较分析出调整的效果。最简单的创建方法是增加EXPNO。

创建一个新数据集。

要建立下面的数据集,你可以点击

按钮,或者选择File菜单下的New,或者输入

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9 氢谱 “new”命令。

NAME hydrogen EXPNO

1

PROCNO 1 点击OK。

9.3 读取标准参数集

输入下面的命令可以读取名为“PROTON”的参数集: “rpar proton”

在提示窗口中选择“acqu”和“proc”,然后“copy”。

无论先前“edasp”窗口是什么设置,一旦读取了PROTON参数集,都会变为“观察氢”的设置。你可以通过输入“edasp”来确认这一点,会发现其他所有的核都被设成了“off”。

9.3.1 “getprosol”表

“prosol”表,可以通过命令“edprosol”调出,是一组谱仪和探头参数的列表。任意通道的任意原子核的参数,例如90度或去耦脉宽及相应的能量水平,都可以存在这里。如果“prosol”文件设置正确,用户可以很容易地得到这些值。使用“getprosol”命令可以自动载入这些值。软件会认出哪个通道设置的是哪个原子核,并读入相应的参数。必须注意的是,只有在“edhead”中定义的当前探头和磁体中的探头一致时,“prosol”才可以正常工作。你在下面的表格中会发现“getprosol”是被推荐使用的最简单的“p1”和“pl1”设置方法。

选择AcquPars标签或者输入“eda”命令,可以看到例如表 9.1种所列的参数。这里只讨论最主要的参数。你应该注意到其中一些参数是和硬件系统相关的,因此在标准参数集不可能有一个“理想”值。你可以使用“ased”命令简要确认参数设置是否正确。

9.4 设置接收机增益

输入“rga”。

谱仪将进行几次采样来选择最合适的增益。确定的RG值会被自动读入“eda”表,供后续的采样使用。

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U9.5 进行采样 9.5 进行采样 要进行采样,可以点击工具栏上的

按钮或者输入“zg”命令。

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9 氢谱 表 9.1 读入PROTON标准参数集后的“eda”表 参数名

参数值

备注

关于脉冲程序的详细描述参见章节8.2

PULPROG zg30 不关键。K相当大,如果你想节省时间,可以改成16K,前提TD 65536 是FID衰减足够快,或“d1”足够长 NS 16 在所有的参数被优化以前,不值得花费时间进行多次采样。如果

你想在开始时节省时间,可以把它改成1 DS 2 两次空扫是相当标准的做法

对于氢谱这是相当宽的,不过,如果是第一次分析某种样品,谱SW 20.6ppm 宽最好还是宽点。注意使用SW比SWH表示谱宽更简单 NUC1 1H SFO1 这个参数仅用于向用户提供信息 见O1P

这将确定发射频率的值和谱图的中心。如果中心频率是O1P 6.175ppm 6.175ppm,谱宽为20.6ppm,将覆盖-4.125ppm至+16.475ppm之间的化学位移。SW越大,这个值约不关键。 BF1 D(s)

系统相关 d1=1-2 s

自动设定

延迟的默认单位是秒。如果输入“2”,会设定一个两秒的延迟。在脉冲程序“zg30”中,d1是唯一的延迟。它是为了让样品有足够的时间进行驰豫,只要不是太短,这个值不关键。对于当前样品,1或2秒就可以了。

参数p1是90度激发脉冲的宽度,脉冲程序“zg30”中使用到的唯一脉宽是p1*0.33。你应该咨询系统管理员如何设定p1。最简单的方法是使用“getprosol”命令。10us只是标准参数集中的典型值。记住如果你设定10us,实际发射的长度是3.3us。如果你熟悉“paropt”过程,你可能会希望优化p1。

p1如果没有被优化,实验也可以进行,不过灵敏度会差些。

PL(dB)

pl1=120dB 你可以咨询系统管理员如何设置pl1。当然,最简单的方法是使

用“getprosol”命令。pl1的优化值取决于特定的系统。记住p1和pl1是联系在一起的。为了保护探头,标准参数集中的pl1被设为120dB。这个值太大了,需要减小。

P(us) p1=10u s

RG 4 优化值和系统硬件有关,RG=4相当的低了,可以使用“rga”

命令来优化接收机增益

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U9.6 傅立叶变换和谱图相位校正 在采样期间,你可以在采样窗口观察FID信号的增长,点击工具栏上的

或者输入

“acqu”命令可以跳出采样窗口。如果NS>1,你可以看到FID的连续累加。注意,采样窗口中的信息是扫描计数器的实时状态,下面的例子将对它进行说明(参照下图)。

图 9.1 采样窗口——扫描计数器的状态

Scan 3/16的含义是谱仪已经完成了三次扫描,当前正值型16次扫描中的第四次。 在BSMS键盘上你也可以看到实时显示 ——脉冲发射

——发送的和被反射的能量 ——ADC的开关

每隔几秒钟就会有一次扫描。你可以一直重复,直到你熟悉了所有的显示。每次只需要输入“zg”就可以采集FID。新的FID信号会覆盖前一次采集的信号(如果你没有增加EXPNO)。

9.6 傅立叶变换和谱图相位校正 选择Processing菜单下的Fourier Transformation,在弹出窗口中选中标准傅立叶变换,点击OK。然后选择Processing菜单下的Phase Correction,在弹出窗口中选中自动

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9 氢谱 相位校正,点击OK。这样就执行了一次傅立叶变换,以及自动相位校正。你也可以首先输入“ft”然后输入“apk”。得到的谱图应该和下图类似:

图 9.2 Cholesterylacetat 的氢谱,十六次扫描。SW=20.66

在进入下一节之前,首先来看一些基本的处理技术。 图9.3 Topspin窗口中一些有用的特性

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U9.7 基本处理:傅立叶变换

9.7 基本处理:傅立叶变换

傅立叶变换可以把FID转换成频率谱图,可以通过“ft”命令调用。图谱的组成点数通过参数SI(size)指定。FID会被转换成一个由实部SI个数据点和虚部SI个数据点构成的图谱。一般的设置是SI=TD/2。如果你读入PROTON参数集,会发现TD=k,SI=32k。 通过点击Processing菜单或者输入“ft”命令,显示会自动返回数据窗口。如果你想再进入采样窗口,输入“acqu”。

如果谱图超出了观察的范围,可以点击图9.3中标出的图谱缩放按钮,使它恢复。 注意在ft命令之后图谱可能会有些变形,这需要使用相位校正技术来纠正。

9.8 相位校正 谱仪硬件内的发射和接收信号的相位不可避免会有偏差,必须要校正回来。如果完成了校正,并且采样条件或者说参数没有发生改变。相位校正量会保持稳定,可以方便的多次调用。下图是相位校正的一个例子。

图9.4 经过相位校正(下)和未经相位校正的谱图(上)

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9 氢谱

用户需要理解零阶和一阶相位校正的区别,两个校正值分别存在参数phc0和phc1中。可以在处理参数表中看到这两个参数。点击数据窗口中的ProcPars标签或者输入“edp”命令可以调出处理参数表。

零阶相位校正对整个图谱应用相同的相位校正,用来校正和信号频率无关的相位偏差。

一阶相位校正应用一个和信号频率成比例的相位校正。这是因为频率偏差一般会包含一个频率相关量。

校正一个图谱的相位,一般零阶和一阶校正都需要进行。有几种方法可供选择,最简单的是通过Processing菜单下的Phase Correction或是“apk”命令调用自动相位校正。 下表总结了一些有用的相位校正方法。用户可以使用不同的方法简化自己的实验。无论应用哪种校正,原始数据都不会受到影响。

表 9.2相位校正方法 窗口

方法

结果

主窗口 选择Processing菜单下的Phase 自动完成相位校正。

Correction或者输入“apk”命令 主窗口 输入“pk”命令 主窗口 输入“fp”命令

使用最近一次的校正值进行校正。 执行傅立叶变换并使用最近一次校正值进行校正。

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U9.9 谱图的校准 相位校默认的相位轴点(phase pivot point)通过调整最强峰的相位可以校正整个谱正模式 是图谱在显示区域内的最强的峰 图。同样的零阶校正量会自动应用到整个

图谱范围。 相位校点击按钮“0”并按住拖动 正模式

相位校点击按钮“1”并按住拖动 正模式

相位校右击目标轴点位置;在弹出菜单中选正模式 择Set pivot point

允许用户使用鼠标进行零阶相位校正

允许用户使用鼠标进行一阶相位校正

9.9 谱图的校准 按照NMR实验的惯例,通过把TMS峰设成0ppm来完成谱图校准。在校准之前,首先把TMS信号峰附近的区域水平放大,可以更精确定位TMS峰的位置。可以认为TMS峰是谱图中频率最低(最靠右)的峰。

图 9.5 放大TMS峰附近的区域

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9 氢谱 9.9.1 水平放大图谱

1、确认当前是Topspin的数据窗口。

2、在感兴趣的区域按下鼠标左键并拖过整个区域,松开鼠标左键。 3、可以通过图9.3所示的按钮恢复谱图的水平缩放。

9.9.2 图谱校准

1、如果需要,可以点击

按钮把水平轴坐标切换成ppm。

2、点击工具栏上的按钮或者输入“.cal”,当前窗口的标签栏会被工具栏所取代。

3、移动红色的标签线到参考峰,点击左键。将会出现一个对话框,设定为你期望的

化学位移值。点击OK,会显示校准后的谱图,Topspin会自动退出校准模式。

谱图如图9.6所示。

图9.6 Cholesterylacetat的氢谱,16次扫描,SW=20.66ppm,TMS峰校准为0ppm

也可以使用命令“sref”来自动校准谱图。程序会自动搜索0ppm区域内的信号峰并自动把其设置为0ppm。如果要使用sref命令,请确认“edlock”表设置正确,而且锁场

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U9.10 使用SW-SFO1功能调整谱宽 时选择了正确的溶剂。

9.10 使用SW-SFO1功能调整谱宽

通过图9.7,我们可以发现cholesterylacetate的NMR信号分布在0-8ppm之间的区域,因此没有必要使用PROTON标准参数集中默认的谱宽SW为20.66ppm(默认谱宽20.66ppm是为了确保采集到所有的样品峰和溶剂峰)。一种有用的技术是直接把显示区域水平方向的范围定义为SW。

点击上部工具栏上的

按钮,程序会有两个动作:

1、 SW被自动设定为显示的范围;

2、 观察频率(SFO1)会被自动设定为显示范围的中心,也就是说SFO1处在中心点

上。

9.10.1 调整cholesterylacetate谱图的SW

由于这将改变采样参数,你可能决定要新建一个数据集。最简单的方法就是增加一个实验号EXPNO。

步骤: 1、 点击

按钮或者输入“new”,创建下面的数据集

NAME hydrogen EXPNO

2

PROCNO 1

这样将会创建一个新数据集“hydrogen 2 1”。察看eda表,你会发现新数据集中所

有的采样参数和“hydrogen 1 1”相同。这样,“hydrogen 1 1”中的参数设置和数据就不会被覆盖了。

2、 设NS为1,采集一个FID并且用“fp”来进行傅立叶变换和相位校正。注意在应

用以有相位校正量的同时TMS也会被校准为0ppm。 3、 把鼠标线移动到10 ppm处(大约),点击并按住左键。 4、 拖动鼠标线到-1 ppm处(大约),松开左键。 5、 现在-1 到 10 ppm之间的谱图填满了显示区域。 6、 点击上部工具栏上的

按钮,SW会被自动设为显示的范围,而SFO1会被设为

显示区域的中心。你可以通过eda表确认新SW值(大约11ppm),O1P和SFO1

也已经设好了。

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9 氢谱 7、 采集一个FID,傅立叶变换,然后校正相位。

注意“fp”命令现在很可能无法进行正确的相位校正,这是因为我们使用了新的SW和SFO1。你可以使用“apk”命令或者手动校正相位,参考9.8节 8、 把NS改成16,采集FID,变换,校正相位。谱图应该如下图示。

图 9.7 Cholesterylacetat的氢谱,16次扫描,SW=12ppm,TMS峰校准为0ppm

9.11 增加扫描次数

谱图的信噪比可以通过信号累加进行改善,改变量和扫描次数的平方根成正比。例如次扫描的谱图信噪比是单次扫描的8倍,但是采样时间也相应延长。扫描次数通过NS的值确定。

1、 点击

按钮或者输入“new”

2、 把EXPNO设为3。当前数据集现在是“hydrogen 3 1”。

3、 点击数据窗口的AcquPars标签,或者输入“eda”,设定NS为。(此外,也可

以直接在命令行输入“ns”,你会被提示输入NS值) 4、 点击工具栏上的

按钮,或者输入“acqu”察看采样窗口。

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U9.11 增加扫描次数 5、 点击工具栏上的

按钮,或者输入“zg”。

注意,现在采样窗口显示的是次采样的实时进度。还会有剩余实验时间。每次发

射脉冲时,BSMS键盘显示会闪烁,还可以看到ADC LED闪烁。

6、 采样完成后,可以进行傅立叶变换和相位校正。所得谱图的信噪比会改善(八倍)。 现在,你可能非常希望使用SINO程序来自动计算信噪比。但是关于的SINO的讲解超出了这本手册的范围,你可以在Topspin Help菜单下的Topspin Processing Reference Manual(Topspin谱图处理参考手册)中找到相关内容。

对比多个谱图最好的方法就是使用多显(Dual Display)功能。这个功能的说明,也可以在Topspin Processing Reference Manual中找到。你现在可能很想使用这个功能吧。

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10 不去耦的13C谱

10.1 简介

这一章节将介绍对cholesterylacetate样品中的碳进行分析。我们使用不带去耦“zg30”脉冲程序开始。下一章会介绍到使用对氢去耦来观察碳是更好的方法。无论如何,对于初学者,不使用去耦进行采样有助于理解去耦的特点。如果只是想要一张谱图,那么可以越过下一章(在执行了下面1-4步之后)。如果探头不适合观察碳,我们需要另换一个探头。更换探头的步骤在参看“更换探头”一节

10.2 步骤

1、把上一节用到的氘代氯仿中的100mg cholesterylacetate替换成1g样品。NMR对碳的灵敏度远不如氢,因此建议使用更浓的样品。

2、放入新样品会丢失锁场。如何锁定新样品参见“锁场步骤”一节。 。 3、重新调整Z和Z2,优化锁线高度(参见“常规匀场”一节)。 4、如果需要对观察13C调谐探头,参考“调谐和匹配探头”5、使用

按钮或者“new”创建一个新数据集,例如:carbon 1/1。

6、使用“rpar C13CPD all”读取参数集C13CPD。

7、输入“edasp”,设置F1通道为13C,设置其它所有通道为“off”。

8、点击数据窗口中的AcquPars标签,或者输入“eda”按照下表设定参数值。你可

以使用“ased”命令来再次确认参数是否被正确设定。

表10.1 “eda”参数值 参数

注释

Pulprog zg30 TD 16k DS 16 DS 0 d1 2s SW 250ppm 碳谱范围比氢谱宽 和前一个氢谱对比

这只是建议值,可以优化。100ppm是碳参数集典型的位移 O1P 100ppm 中文版 003

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10 不去耦的13C谱 RG 8k 此外,你还可以使用“rga”命令来设置接收机增益 参数“p1”是90度激发脉冲的长度,“zg30”程序使用的脉冲参数为P1*0.33。你应该咨询系统管理员怎样优化p1或者使用

P1 - “getprosol”命令。如果你熟悉“paropt”,可以用它来优化

p1。当然如果p1没有优化,实验也可进行,但是灵敏度会不

理想。 你可能需要咨询系统管理员如何设置“pl1”或者使用getprosol

pl1 - 命令。“pl1”的优化值依系统和探头而不同。记住“p1”和“pl1”是相关联的。 9、使用“getprosol”读取“prosol”文件。 10、输入“rga”设定合适的接收机增益(RG)。 11、点击

按钮或输入“zg”来采集FID。

注意BSMS键盘上X核对应的一行LED将会闪烁。 12、输入“si”,在提示框输入8k。 13、输入“ft”。

14、校正谱图的相位并保存。注意氢谱相位信息不能应用到碳谱上。但是,如果13C谱图完成相位校正,这个信息可以应用到后续的13C谱。此外可以输入“apk”自动校正相位。

得到的谱图看上去可能很嘈杂,只有一个,或者没有明显的峰。这个最高的峰是氯仿的溶剂峰。展开这个峰周围的谱图,你会发现由于氘的耦合,这个峰实际是一个三重峰(不同于氢的自旋数1/2,氘的自旋数为1,这导致了不同的裂分)。 15、如果可以看到CDCl3信号,把这个三重峰的中间峰校准为77ppm。这等同于把TMS峰校准成0ppm,但是现在看不到TMS峰。

图 10.1 Cholesterylacetate的13C谱。单次扫描、无去耦。

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U10.2 步骤

用户现在可能想,通过增加扫描次数,也许可以显著降低谱图的噪音。 16、创建数据集“carbon/2/1”。

17、设定NS为8,16,32,或者其它16的倍数。 18、采集FID,傅立叶变换,相位校正。

下面是一个96次扫描的Cholesterylacetate 13C谱图。 图 10.2 Cholesterylacetate的13C谱。96次扫描、无去耦。

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10 不去耦的13C谱

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11 去耦氢的13C谱

11.1 简介 下面的描述将用到名为C13CPD的标准参数集,这个参数集是在使用CPD(复合脉冲去耦,Composite Pulse Decoupling)序列去耦氢的情况下观察碳。碳观察脉冲通过通道1发射,同时通道2会在采样前,中,后连续发射去耦脉冲。这个参数集中使用的脉冲程序有一个特点:在观察脉冲发射前,会调整去耦能量。细节请参阅“脉冲程序zgpg30”一节。

主要步骤有:

1、 建立新数据集;

2、 读入标准参数集“C13CPD”; 3、 确定并设置去耦频率;

4、 设置参数pl12,pl13和pcpd2。

11.2 详细步骤 1、在“carbon 2 1”的基础上创建新数据集“carbon 3 1”。这样可以确保O1偏移频

率等于“carbon 2 1”。如果O1P不是100ppm,那么你会发现C13CPD标准参数集会自动把它设成100ppm,如果你没有执行prosol,那么pl1和p1的值也已经被改写。

2、输入“rpar C13CPD”,在提示窗口内点击acqu,然后点击OK。 C13CPD的主要特点是edasp将被设成: 通道F1 = 13C 通道F2 = 1H

其他所有通道都被设为off。

脉冲程序zgpg30作为C13CPD的一部分被加载。这将在“脉冲程序zgpg30”一节中进行详细解释。我们把解释附在本章的后面,不希望它打断实验的步骤。但是如果你不熟悉这个脉冲程序,你应该现在就阅读这个介绍。

要设置的主要参数有,观察脉冲的p1和pl1,还有去耦频率SFO2,去耦能量级别pl12和pl13,还有去耦脉冲的长度pcpd2。p1和pl1已经在前一章介绍的实验中确定。下一节将讲解如何确定SFO2。

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11 去耦氢的13C谱 =11.3 确定去耦频率

1、通过Topspin左边的浏览窗口打开“hydrogen 2 1”。

这将调出“hydrogen 2 1”数据集中的谱图,和图9.7相似。如果我们忽略TMS峰和氯仿峰。可以发现所有的信号都分布在0.5~5.5ppm之内。那么你可以认为我们应该设定去耦频率为3ppm。应该注意的一点是CPD去耦是去耦一个频率段内的所有氢信号,因此它采用的是一个频率区间的中心值而不是某个精确频率值。C13CPD会把O2P设为4ppm。你应该明白,只有在经过校准的谱图上的ppm值才是正确的。通过定义TMS峰的值为0ppm来校准谱图的方法,请参考“校准谱图”一节

2、通过Topspin浏览窗口打开“carbon 3 1”,在采样参数表内把O2P设为3ppm。 3、点击数据窗口内的AcquPars标签,或者在命令行输入“eda”,然后按下表设置参数。

表11.1 载入C13CPD后的参数设置 参数 C13CPD参

数集值 PULPROG zgpg30 新参数值

注释

zgpg30 对于这个脉冲程序的解释,参考11.5节

不重要,k已经相当大 TD 65536 k 1k太大了。最小可以设为8 NS 1k 96 DS 2 2

碳谱覆盖了一个很宽的范围,这里不要减小

SW 238ppm 238ppm

O1P 100ppm - 这个频率应该对应“carbon 2 1”中的SFO1 这对于覆盖一个区域的CPD去耦不重要 O2P 4ppm 3ppm p1是90度激发脉冲的长度,zgpg30使用的脉冲长p1 14u - 度是p1*0.33。使用“carbon 2 1”中的设定值,或者输入“getprosol” “carbon 2 1”中的设定值,或者输入“getprosol”pl1 120dB - 使用,或者使用pl12 120dB - 请咨询系统管理员如何设置“pl12”

getprosol命令。另请参考“调整去耦参数”一节 ,或者使用pl13 120dB - 请咨询系统管理员如何设置“pl12”

getprosol命令。另请参考“调整去耦参数”一节 d11 30ms 30ms D数组

不重要 d12 2s 你可以使用“ased”命令来检查参数设置是否正确。

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U11.4 调整去耦参数 4、点击

按钮或者输入“zg”来开始采样。

5、变换,然后相位校正。

下图是去耦谱图的一个例子。注意,现在可以看到0ppm的TMS峰。 图11.1 Cholesterylacetate的13C谱图。96次扫描,带去耦。

注意信噪比也有了很大改善。去耦的效果是如此显著,有经验的用户极少浪费时间在不去耦的情况下采集13C谱。

11.4 调整去耦参数

去耦的质量取决于两个因素: 1、 SFO2,去耦频率;

2、 pl12和pl13,去耦序列的能量。

你可能希望通过改变这些参数值来探索他们的效果。例如,把去耦频率设定为3,8,13ppm,把pl12和pl13设定为10到20dB之间的任意值来分别观察产生的效果。一般pl13比pl12大3dB,这是为了满足NOE法则。如果你想把pl12和pl13的值设定为5dB以下,请咨询有经验的用户,因为这会使探头因为过热而损坏。

11.5 脉冲程序zgpg30 点击数据窗口的PulsProg标签或者输入“edcpul”命令可以看到一个脉冲程序的副本(如图11.2所示)。为了描述的方便,这里加上了行号,在Topspin里面是不会出现行号

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11 去耦氢的13C谱 的。

前四行是注释。第一行是脉冲程序的名字,第二行是版本号。第三行说明这个程序适用于1D NMR去耦实验。第四行提示用户这里使用的是30度脉冲,而不是90度(因此,程序名中有个30)。

图11.2 脉冲程序zgpg30

100(104)

003中文版

U11.5 脉冲程序zgpg30

第五行

这一行不是注释,是为了把另外一个处理脉冲程序文本的文件包含进来。 第六、七行

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11 去耦氢的13C谱 两个延迟d11和d12被分别定义为30毫秒和20微秒,它们的含义在程序最后有解释。标准参数集中的C13CPD使用的是相同的设置。

第八行:1 ze

这一行不是分号开头,是实际程序的第一行。程序中的任何一行都可以编号来形成循环,而这一行自然被编为1。“ze”会使现存在内存中的所有数据被第一次扫描采集的数据替代。后续扫描所采集的数据会追加到内存中。或者说,“ze”命令清空内存,为实验要采集的数据做准备。

第九行:d12 pl13:f2

这行把F2通道的去耦能量设定为pl13。d12确保在去耦开始前有足够的时间完成设置。

第十行:d1 cpd2:f2

这将开始eda表中定义的cpdprg2程序中的去耦序列。切换到eda表可以发现标准参数集把cpdprg2设定为waltz16。这个去耦将以pl13的能量持续d1时间

第十一行:d12 pl1:f2

为了在激发脉冲和采样时继续去耦,F2通道的能量被设定为pl12。延迟d12是为了保证有时间完成设置。

第十二行:p1*0.33 ph1

第十二行是个标准的30度激发脉冲,在“zg30程序详解”一节已有过介绍。不同的是现在使用的是碳频率而不是氢频率。长度当然也不同。

第十三行:go=2 ph31

这一行在“zg30程序详解”一节也已有过介绍。 第十四行:wr #0 参见“zg30程序详解” 第十五行:d11 do:f2

do表示decoupling off,即关闭去耦。

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12 基本故障排除

12.1 简介

在这本入门级的手册中,不适合介绍任何高等级的故障排除技巧。但是,所有的用户至少应该可以完成开关机操作。

图 12.1 机柜、AQS和BSMS的主开关位置

12.2 打开和关闭谱仪 在正常操作时,机柜主、子单元和电脑主机都处于打开状态,即使没有进行实验。如果需要更换AQS或BSMS框架中的某个单元,只需要关闭AQS或BSMS就可以了,没有必要关闭整个系统。

用户需要注意:

1、在打开(关闭)AQS时,CCU10会自动启动(关闭)。

2、在打开(关闭)BSMS时,BSMS CPU和键盘会自动启动(关闭)。

12.3 谱仪开机

步骤如下:

完成整个谱仪的开机需要以下步骤:

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12 基本故障排除 1、打开电脑主机。登录,但是不要运行Topspin。 2、使用机柜前面板上的绿色开关打开机柜主电源。 3、打开机柜内的系统,AQS,功放,BSMS,VTU等。

4、打开AQS会使CCU10 重启。如果要观察启动的进度,可以使用超级终端(限于PC系统)或者打开Linux/UNIX界面(限于Linux系统)“logging onto spect”“logging onto 。

spect”物理上是登录到CCU10,一般通过到tty00的RS232连接完成。启动完成后会显示“system is ready”。 5、打开BSMS会使BSMS CPU重新启动。观察BSMS键盘,会有“booting”“connecting”的显示信息。

6、在电脑主机上运行Topspin。

在重启CCU10后可以任意再次“log onto spect”。

还可以使用“telnet spect”通过以太网连接“log onto spect”。

12.4 谱仪关机

完成整个谱仪的关机需要以下步骤: 1、退出Topspin。

2、使用“init 5”关闭CCU10然后关闭AQS。点击超级终端图标,并输入“init 5”命令。

3、关闭所有内部单元,BSMS、功放、VTU等。 4、使用机箱前面板的红色开关关闭机柜电源。

12.4.1 在Windows系统运行Topspin

1、确认谱仪(“spect”)已经启动。可以点击主机桌面上的CCU超级终端图标来确认。还可以使用“telnet spect”通过以太网连接来访问。

2、点击桌面上的Topspin图标。

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