依据相关法律的规定，发包人应按照合同约定方式预留保证金，保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3％。如果是以银行保函替代预留保证金的，保函金额不得高于3％。
《建设工程质量保证金管理办法》
第六条在工程项目竣工前，已经缴纳履约保证金的，发包人不得同时预留工程质量保证金。
采用工程质量保证担保、工程质量保险等其他保证方式的，发包人不得再预留保证金。
第七条发包人应按照合同约定方式预留保证金，保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3％。合同约定由承包人以银行保函替代预留保证金的，保函金额不得高于工程价款结算总额的3％。
一、合同无效退工程质量保证金吗
在实践中，当出现以下情形时，建筑工程合同就可以认定为无效合同：
1、不具有经营建筑活动主体资格的企业或个人订立的建筑工程合同。
2、没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义的。
3、建筑工程必须进行招标而未招标或者中标无效的。
4、承包人进行非法转包、违法分包的。
5、发包人与承包人签订的三无建筑工程合同。所谓三无，是指建筑工程没有取得土地使用权证、没有取得建筑工程规划许可证、没有办理报建手续。
6、根据《民法典》相关规定，建筑工程合同的其他无效情形。
二、建筑工程合同无效情形
（1）采取欺诈、胁迫手段所签订的建筑工程合同；
（2）恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益的建筑工程合同；
（3）以合法形式掩盖非法目的的建筑工程合同；
（4）损害社会公共利益的建筑工程合同；
（5）违法法律、法规的强制性规定的建筑工程合同。
而一旦建筑工程合同被认定为无效的，按照《民法典》规定，合同无效或者被撤销后，因该合同取得的财产，应当予以返还，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
也就是说，建筑工程合同无效，发包人应该将工程质量保证金退还给承包人，如发包人有过错的，还需要赔偿承包人的损失。
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