撤销著作权登记的方式：撤销申请人向国家版权局提交司法判决、著作权行政管理部门作出的行政处罚决定等证明材料，申请撤销。国家版权局经查证属实的，应当予以撤销，并公告。
【法律依据】
《计算机软件著作权登记办法》第二十三条
国家版权局根据下列情况之一，可以撤销登记：
（一）最终的司法判决；
（二）著作权行政管理部门作出的行政处罚决定。
第二十四条
中国版权保护中心可以根据申请人的申请，撤销登记。
第二十七条
软件登记公告的内容如下：
（一）软件著作权的登记；
（二）软件著作权合同登记事项；
（三）软件登记的撤销；
（四）其他事项。